Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med16Q6PGF3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Med16Q6PGF3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Med16Q6PGF3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Med16Q6PGF3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Med16Q6PGF3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Med16Q6PGF3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Med16Q6PGF3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Med16Q6PGF3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Med16Q6PGF3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Med16Q6PGF3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Med16Q6PGF3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Med16Q6PGF3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Med16Q6PGF3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Med16Q6PGF3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Med16Q6PGF3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Med16Q6PGF3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Med16Q6PGF3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Med16Q6PGF3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Med16Q6PGF3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Med16Q6PGF3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Med16Q6PGF3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Med16Q6PGF3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Med16Q6PGF3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Med16Q6PGF3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Med16Q6PGF3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Med16Q6PGF3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Med16Q6PGF3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Med16Q6PGF3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Med16Q6PGF3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Med16Q6PGF3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Med16Q6PGF3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Med16Q6PGF3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Med16Q6PGF3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Med16Q6PGF3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Med16Q6PGF3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Med16Q6PGF3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Med16Q6PGF3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Med16Q6PGF3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Med16Q6PGF3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Med16Q6PGF3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Med16Q6PGF3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Med16Q6PGF3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Med16Q6PGF3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Med16Q6PGF3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Med16Q6PGF3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Med16Q6PGF3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Med16Q6PGF3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Med16Q6PGF3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Med16Q6PGF3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Med16Q6PGF3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Med16Q6PGF3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Med16Q6PGF3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Med16Q6PGF3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Med16Q6PGF3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Med16Q6PGF3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Med16Q6PGF3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Med16Q6PGF3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Med16Q6PGF3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Med16Q6PGF3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Med16Q6PGF3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Med16Q6PGF3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Med16Q6PGF3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Med16Q6PGF3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Med16Q6PGF3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Med16Q6PGF3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Med16Q6PGF3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Med16Q6PGF3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Med16Q6PGF3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Med16Q6PGF3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Med16Q6PGF3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Med16Q6PGF3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Med16Q6PGF3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Med16Q6PGF3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Med16Q6PGF3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Med16Q6PGF3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Med16Q6PGF3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Med16Q6PGF3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Med16Q6PGF3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Med16Q6PGF3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Med16Q6PGF3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Med16Q6PGF3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Med16Q6PGF3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Med16Q6PGF3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Med16Q6PGF3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Med16Q6PGF3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Med16Q6PGF3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Med16Q6PGF3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Med16Q6PGF3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Med16Q6PGF3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Med16Q6PGF3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Med16Q6PGF3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Med16Q6PGF3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Med16Q6PGF3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Med16Q6PGF3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Med16Q6PGF3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med16Q6PGF3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med16Q6PGF3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med16Q6PGF3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med16Q6PGF3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms