Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc82Q6PG04 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc82Q6PG04 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc82Q6PG04 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc82Q6PG04 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc82Q6PG04 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc82Q6PG04 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc82Q6PG04 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc82Q6PG04 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc82Q6PG04 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc82Q6PG04 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc82Q6PG04 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc82Q6PG04 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc82Q6PG04 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc82Q6PG04 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc82Q6PG04 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc82Q6PG04 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc82Q6PG04 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc82Q6PG04 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc82Q6PG04 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc82Q6PG04 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc82Q6PG04 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc82Q6PG04 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc82Q6PG04 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc82Q6PG04 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc82Q6PG04 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc82Q6PG04 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc82Q6PG04 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc82Q6PG04 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc82Q6PG04 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc82Q6PG04 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc82Q6PG04 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc82Q6PG04 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc82Q6PG04 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc82Q6PG04 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc82Q6PG04 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc82Q6PG04 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc82Q6PG04 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc82Q6PG04 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc82Q6PG04 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc82Q6PG04 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc82Q6PG04 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc82Q6PG04 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc82Q6PG04 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc82Q6PG04 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc82Q6PG04 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc82Q6PG04 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc82Q6PG04 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc82Q6PG04 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc82Q6PG04 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc82Q6PG04 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc82Q6PG04 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc82Q6PG04 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc82Q6PG04 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc82Q6PG04 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc82Q6PG04 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc82Q6PG04 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc82Q6PG04 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc82Q6PG04 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc82Q6PG04 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc82Q6PG04 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc82Q6PG04 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc82Q6PG04 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc82Q6PG04 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc82Q6PG04 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc82Q6PG04 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc82Q6PG04 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc82Q6PG04 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc82Q6PG04 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc82Q6PG04 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc82Q6PG04 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc82Q6PG04 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc82Q6PG04 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc82Q6PG04 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc82Q6PG04 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc82Q6PG04 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc82Q6PG04 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc82Q6PG04 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc82Q6PG04 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc82Q6PG04 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc82Q6PG04 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc82Q6PG04 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc82Q6PG04 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc82Q6PG04 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc82Q6PG04 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc82Q6PG04 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc82Q6PG04 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc82Q6PG04 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc82Q6PG04 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc82Q6PG04 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc82Q6PG04 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc82Q6PG04 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc82Q6PG04 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc82Q6PG04 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc82Q6PG04 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc82Q6PG04 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc82Q6PG04 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc82Q6PG04 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc82Q6PG04 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc82Q6PG04 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms