Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI5

Ecm29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm29Q6PDI5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ecm29Q6PDI5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ecm29Q6PDI5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ecm29Q6PDI5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ecm29Q6PDI5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ecm29Q6PDI5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ecm29Q6PDI5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ecm29Q6PDI5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ecm29Q6PDI5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ecm29Q6PDI5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ecm29Q6PDI5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ecm29Q6PDI5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ecm29Q6PDI5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ecm29Q6PDI5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ecm29Q6PDI5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ecm29Q6PDI5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ecm29Q6PDI5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ecm29Q6PDI5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ecm29Q6PDI5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ecm29Q6PDI5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ecm29Q6PDI5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ecm29Q6PDI5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ecm29Q6PDI5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ecm29Q6PDI5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ecm29Q6PDI5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ecm29Q6PDI5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ecm29Q6PDI5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ecm29Q6PDI5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ecm29Q6PDI5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ecm29Q6PDI5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ecm29Q6PDI5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ecm29Q6PDI5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ecm29Q6PDI5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ecm29Q6PDI5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ecm29Q6PDI5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ecm29Q6PDI5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ecm29Q6PDI5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ecm29Q6PDI5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ecm29Q6PDI5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ecm29Q6PDI5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ecm29Q6PDI5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ecm29Q6PDI5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ecm29Q6PDI5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ecm29Q6PDI5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ecm29Q6PDI5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ecm29Q6PDI5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ecm29Q6PDI5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ecm29Q6PDI5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ecm29Q6PDI5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ecm29Q6PDI5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ecm29Q6PDI5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ecm29Q6PDI5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ecm29Q6PDI5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ecm29Q6PDI5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ecm29Q6PDI5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ecm29Q6PDI5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ecm29Q6PDI5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ecm29Q6PDI5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ecm29Q6PDI5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ecm29Q6PDI5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ecm29Q6PDI5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ecm29Q6PDI5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ecm29Q6PDI5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ecm29Q6PDI5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ecm29Q6PDI5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ecm29Q6PDI5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ecm29Q6PDI5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ecm29Q6PDI5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ecm29Q6PDI5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ecm29Q6PDI5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ecm29Q6PDI5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ecm29Q6PDI5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ecm29Q6PDI5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ecm29Q6PDI5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ecm29Q6PDI5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ecm29Q6PDI5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ecm29Q6PDI5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ecm29Q6PDI5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ecm29Q6PDI5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ecm29Q6PDI5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ecm29Q6PDI5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ecm29Q6PDI5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ecm29Q6PDI5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ecm29Q6PDI5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ecm29Q6PDI5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ecm29Q6PDI5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ecm29Q6PDI5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ecm29Q6PDI5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ecm29Q6PDI5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ecm29Q6PDI5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ecm29Q6PDI5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ecm29Q6PDI5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ecm29Q6PDI5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ecm29Q6PDI5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ecm29Q6PDI5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ecm29Q6PDI5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ecm29Q6PDI5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ecm29Q6PDI5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ecm29Q6PDI5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ecm29Q6PDI5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms