Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8X1

Snx6, Sorting nexin-6, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx6Q6P8X1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx6Q6P8X1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx6Q6P8X1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx6Q6P8X1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx6Q6P8X1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx6Q6P8X1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx6Q6P8X1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx6Q6P8X1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx6Q6P8X1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx6Q6P8X1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx6Q6P8X1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx6Q6P8X1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx6Q6P8X1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx6Q6P8X1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx6Q6P8X1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx6Q6P8X1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx6Q6P8X1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx6Q6P8X1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx6Q6P8X1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx6Q6P8X1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx6Q6P8X1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx6Q6P8X1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx6Q6P8X1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx6Q6P8X1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx6Q6P8X1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx6Q6P8X1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx6Q6P8X1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx6Q6P8X1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx6Q6P8X1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx6Q6P8X1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx6Q6P8X1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx6Q6P8X1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx6Q6P8X1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx6Q6P8X1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx6Q6P8X1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx6Q6P8X1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx6Q6P8X1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx6Q6P8X1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx6Q6P8X1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx6Q6P8X1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx6Q6P8X1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx6Q6P8X1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx6Q6P8X1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx6Q6P8X1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx6Q6P8X1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx6Q6P8X1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx6Q6P8X1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx6Q6P8X1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx6Q6P8X1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx6Q6P8X1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx6Q6P8X1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx6Q6P8X1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx6Q6P8X1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx6Q6P8X1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx6Q6P8X1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx6Q6P8X1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx6Q6P8X1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx6Q6P8X1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx6Q6P8X1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx6Q6P8X1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx6Q6P8X1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx6Q6P8X1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx6Q6P8X1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx6Q6P8X1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx6Q6P8X1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx6Q6P8X1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx6Q6P8X1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx6Q6P8X1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx6Q6P8X1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx6Q6P8X1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx6Q6P8X1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx6Q6P8X1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx6Q6P8X1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx6Q6P8X1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx6Q6P8X1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx6Q6P8X1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx6Q6P8X1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx6Q6P8X1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx6Q6P8X1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx6Q6P8X1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx6Q6P8X1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snx6Q6P8X1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snx6Q6P8X1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snx6Q6P8X1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snx6Q6P8X1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snx6Q6P8X1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snx6Q6P8X1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx6Q6P8X1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx6Q6P8X1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx6Q6P8X1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx6Q6P8X1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx6Q6P8X1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx6Q6P8X1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx6Q6P8X1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx6Q6P8X1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx6Q6P8X1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx6Q6P8X1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx6Q6P8X1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx6Q6P8X1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx6Q6P8X1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms