Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZM9

Hdac4, Histone deacetylase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac4Q6NZM9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hdac4Q6NZM9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hdac4Q6NZM9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hdac4Q6NZM9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hdac4Q6NZM9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hdac4Q6NZM9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hdac4Q6NZM9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hdac4Q6NZM9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hdac4Q6NZM9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hdac4Q6NZM9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hdac4Q6NZM9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hdac4Q6NZM9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hdac4Q6NZM9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hdac4Q6NZM9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hdac4Q6NZM9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hdac4Q6NZM9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hdac4Q6NZM9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Hdac4Q6NZM9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hdac4Q6NZM9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hdac4Q6NZM9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hdac4Q6NZM9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Hdac4Q6NZM9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Hdac4Q6NZM9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hdac4Q6NZM9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hdac4Q6NZM9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hdac4Q6NZM9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hdac4Q6NZM9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hdac4Q6NZM9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hdac4Q6NZM9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hdac4Q6NZM9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hdac4Q6NZM9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hdac4Q6NZM9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hdac4Q6NZM9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hdac4Q6NZM9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hdac4Q6NZM9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hdac4Q6NZM9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hdac4Q6NZM9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hdac4Q6NZM9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hdac4Q6NZM9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hdac4Q6NZM9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hdac4Q6NZM9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hdac4Q6NZM9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdac4Q6NZM9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdac4Q6NZM9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdac4Q6NZM9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdac4Q6NZM9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdac4Q6NZM9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdac4Q6NZM9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdac4Q6NZM9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdac4Q6NZM9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdac4Q6NZM9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdac4Q6NZM9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdac4Q6NZM9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hdac4Q6NZM9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hdac4Q6NZM9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hdac4Q6NZM9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hdac4Q6NZM9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Hdac4Q6NZM9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hdac4Q6NZM9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hdac4Q6NZM9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Hdac4Q6NZM9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hdac4Q6NZM9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hdac4Q6NZM9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Hdac4Q6NZM9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hdac4Q6NZM9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hdac4Q6NZM9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hdac4Q6NZM9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hdac4Q6NZM9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hdac4Q6NZM9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hdac4Q6NZM9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hdac4Q6NZM9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hdac4Q6NZM9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hdac4Q6NZM9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hdac4Q6NZM9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hdac4Q6NZM9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hdac4Q6NZM9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Hdac4Q6NZM9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hdac4Q6NZM9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hdac4Q6NZM9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hdac4Q6NZM9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hdac4Q6NZM9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hdac4Q6NZM9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hdac4Q6NZM9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hdac4Q6NZM9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hdac4Q6NZM9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Hdac4Q6NZM9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hdac4Q6NZM9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hdac4Q6NZM9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdac4Q6NZM9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdac4Q6NZM9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdac4Q6NZM9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdac4Q6NZM9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdac4Q6NZM9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdac4Q6NZM9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdac4Q6NZM9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdac4Q6NZM9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdac4Q6NZM9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdac4Q6NZM9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdac4Q6NZM9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdac4Q6NZM9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms