Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Szrd1Q6NXN1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Szrd1Q6NXN1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Szrd1Q6NXN1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Szrd1Q6NXN1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Szrd1Q6NXN1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Szrd1Q6NXN1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Szrd1Q6NXN1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Szrd1Q6NXN1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Szrd1Q6NXN1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Szrd1Q6NXN1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Szrd1Q6NXN1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Szrd1Q6NXN1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Szrd1Q6NXN1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Szrd1Q6NXN1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Szrd1Q6NXN1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Szrd1Q6NXN1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Szrd1Q6NXN1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Szrd1Q6NXN1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Szrd1Q6NXN1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Szrd1Q6NXN1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Szrd1Q6NXN1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Szrd1Q6NXN1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Szrd1Q6NXN1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Szrd1Q6NXN1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Szrd1Q6NXN1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Szrd1Q6NXN1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Szrd1Q6NXN1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Szrd1Q6NXN1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Szrd1Q6NXN1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Szrd1Q6NXN1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Szrd1Q6NXN1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Szrd1Q6NXN1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Szrd1Q6NXN1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Szrd1Q6NXN1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Szrd1Q6NXN1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Szrd1Q6NXN1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Szrd1Q6NXN1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Szrd1Q6NXN1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Szrd1Q6NXN1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Szrd1Q6NXN1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Szrd1Q6NXN1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Szrd1Q6NXN1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Szrd1Q6NXN1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms