Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fndc3bQ6NWW9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fndc3bQ6NWW9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fndc3bQ6NWW9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Fndc3bQ6NWW9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Fndc3bQ6NWW9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fndc3bQ6NWW9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fndc3bQ6NWW9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fndc3bQ6NWW9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fndc3bQ6NWW9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fndc3bQ6NWW9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fndc3bQ6NWW9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fndc3bQ6NWW9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fndc3bQ6NWW9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fndc3bQ6NWW9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fndc3bQ6NWW9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fndc3bQ6NWW9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fndc3bQ6NWW9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fndc3bQ6NWW9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fndc3bQ6NWW9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fndc3bQ6NWW9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fndc3bQ6NWW9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fndc3bQ6NWW9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fndc3bQ6NWW9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fndc3bQ6NWW9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fndc3bQ6NWW9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Fndc3bQ6NWW9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fndc3bQ6NWW9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fndc3bQ6NWW9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fndc3bQ6NWW9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Fndc3bQ6NWW9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fndc3bQ6NWW9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fndc3bQ6NWW9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Fndc3bQ6NWW9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fndc3bQ6NWW9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fndc3bQ6NWW9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fndc3bQ6NWW9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fndc3bQ6NWW9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fndc3bQ6NWW9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fndc3bQ6NWW9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fndc3bQ6NWW9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fndc3bQ6NWW9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fndc3bQ6NWW9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fndc3bQ6NWW9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fndc3bQ6NWW9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fndc3bQ6NWW9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fndc3bQ6NWW9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fndc3bQ6NWW9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fndc3bQ6NWW9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fndc3bQ6NWW9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fndc3bQ6NWW9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fndc3bQ6NWW9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fndc3bQ6NWW9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fndc3bQ6NWW9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fndc3bQ6NWW9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fndc3bQ6NWW9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fndc3bQ6NWW9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fndc3bQ6NWW9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fndc3bQ6NWW9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fndc3bQ6NWW9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fndc3bQ6NWW9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fndc3bQ6NWW9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fndc3bQ6NWW9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Fndc3bQ6NWW9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fndc3bQ6NWW9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fndc3bQ6NWW9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fndc3bQ6NWW9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fndc3bQ6NWW9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Fndc3bQ6NWW9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fndc3bQ6NWW9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fndc3bQ6NWW9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fndc3bQ6NWW9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Fndc3bQ6NWW9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fndc3bQ6NWW9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fndc3bQ6NWW9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fndc3bQ6NWW9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fndc3bQ6NWW9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fndc3bQ6NWW9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fndc3bQ6NWW9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Fndc3bQ6NWW9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fndc3bQ6NWW9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fndc3bQ6NWW9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fndc3bQ6NWW9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fndc3bQ6NWW9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fndc3bQ6NWW9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Fndc3bQ6NWW9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fndc3bQ6NWW9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fndc3bQ6NWW9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fndc3bQ6NWW9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fndc3bQ6NWW9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fndc3bQ6NWW9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fndc3bQ6NWW9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fndc3bQ6NWW9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fndc3bQ6NWW9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fndc3bQ6NWW9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fndc3bQ6NWW9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fndc3bQ6NWW9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fndc3bQ6NWW9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fndc3bQ6NWW9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fndc3bQ6NWW9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms