Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE8

Wdr44, WD repeat-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr44Q6NVE8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Wdr44Q6NVE8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Wdr44Q6NVE8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Wdr44Q6NVE8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Wdr44Q6NVE8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Wdr44Q6NVE8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Wdr44Q6NVE8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Wdr44Q6NVE8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Wdr44Q6NVE8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Wdr44Q6NVE8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Wdr44Q6NVE8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Wdr44Q6NVE8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Wdr44Q6NVE8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Wdr44Q6NVE8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Wdr44Q6NVE8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Wdr44Q6NVE8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Wdr44Q6NVE8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Wdr44Q6NVE8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Wdr44Q6NVE8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Wdr44Q6NVE8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Wdr44Q6NVE8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Wdr44Q6NVE8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Wdr44Q6NVE8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Wdr44Q6NVE8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Wdr44Q6NVE8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Wdr44Q6NVE8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Wdr44Q6NVE8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Wdr44Q6NVE8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Wdr44Q6NVE8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Wdr44Q6NVE8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Wdr44Q6NVE8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Wdr44Q6NVE8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Wdr44Q6NVE8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Wdr44Q6NVE8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Wdr44Q6NVE8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Wdr44Q6NVE8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Wdr44Q6NVE8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Wdr44Q6NVE8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Wdr44Q6NVE8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Wdr44Q6NVE8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Wdr44Q6NVE8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Wdr44Q6NVE8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Wdr44Q6NVE8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Wdr44Q6NVE8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Wdr44Q6NVE8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Wdr44Q6NVE8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Wdr44Q6NVE8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Wdr44Q6NVE8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Wdr44Q6NVE8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Wdr44Q6NVE8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Wdr44Q6NVE8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Wdr44Q6NVE8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Wdr44Q6NVE8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Wdr44Q6NVE8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Wdr44Q6NVE8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Wdr44Q6NVE8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Wdr44Q6NVE8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Wdr44Q6NVE8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Wdr44Q6NVE8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Wdr44Q6NVE8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Wdr44Q6NVE8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Wdr44Q6NVE8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Wdr44Q6NVE8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Wdr44Q6NVE8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Wdr44Q6NVE8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Wdr44Q6NVE8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Wdr44Q6NVE8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Wdr44Q6NVE8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Wdr44Q6NVE8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Wdr44Q6NVE8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Wdr44Q6NVE8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Wdr44Q6NVE8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Wdr44Q6NVE8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Wdr44Q6NVE8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Wdr44Q6NVE8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Wdr44Q6NVE8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Wdr44Q6NVE8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Wdr44Q6NVE8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Wdr44Q6NVE8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Wdr44Q6NVE8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Wdr44Q6NVE8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Wdr44Q6NVE8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Wdr44Q6NVE8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Wdr44Q6NVE8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Wdr44Q6NVE8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Wdr44Q6NVE8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Wdr44Q6NVE8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Wdr44Q6NVE8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Wdr44Q6NVE8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Wdr44Q6NVE8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Wdr44Q6NVE8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Wdr44Q6NVE8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Wdr44Q6NVE8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Wdr44Q6NVE8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Wdr44Q6NVE8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Wdr44Q6NVE8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Wdr44Q6NVE8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Wdr44Q6NVE8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Wdr44Q6NVE8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Wdr44Q6NVE8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms