Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD9

Bfsp2, Phakinin, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bfsp2Q6NVD9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bfsp2Q6NVD9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bfsp2Q6NVD9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bfsp2Q6NVD9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bfsp2Q6NVD9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bfsp2Q6NVD9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bfsp2Q6NVD9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bfsp2Q6NVD9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bfsp2Q6NVD9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bfsp2Q6NVD9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bfsp2Q6NVD9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bfsp2Q6NVD9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bfsp2Q6NVD9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bfsp2Q6NVD9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bfsp2Q6NVD9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bfsp2Q6NVD9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bfsp2Q6NVD9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bfsp2Q6NVD9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bfsp2Q6NVD9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bfsp2Q6NVD9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bfsp2Q6NVD9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bfsp2Q6NVD9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Bfsp2Q6NVD9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bfsp2Q6NVD9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bfsp2Q6NVD9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bfsp2Q6NVD9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bfsp2Q6NVD9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Bfsp2Q6NVD9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bfsp2Q6NVD9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bfsp2Q6NVD9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bfsp2Q6NVD9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bfsp2Q6NVD9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bfsp2Q6NVD9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Bfsp2Q6NVD9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bfsp2Q6NVD9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bfsp2Q6NVD9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bfsp2Q6NVD9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bfsp2Q6NVD9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bfsp2Q6NVD9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bfsp2Q6NVD9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bfsp2Q6NVD9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bfsp2Q6NVD9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bfsp2Q6NVD9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bfsp2Q6NVD9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bfsp2Q6NVD9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bfsp2Q6NVD9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bfsp2Q6NVD9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Bfsp2Q6NVD9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bfsp2Q6NVD9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Bfsp2Q6NVD9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bfsp2Q6NVD9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bfsp2Q6NVD9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bfsp2Q6NVD9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bfsp2Q6NVD9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bfsp2Q6NVD9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bfsp2Q6NVD9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bfsp2Q6NVD9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bfsp2Q6NVD9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bfsp2Q6NVD9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bfsp2Q6NVD9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bfsp2Q6NVD9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bfsp2Q6NVD9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bfsp2Q6NVD9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bfsp2Q6NVD9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bfsp2Q6NVD9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bfsp2Q6NVD9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bfsp2Q6NVD9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bfsp2Q6NVD9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bfsp2Q6NVD9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bfsp2Q6NVD9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bfsp2Q6NVD9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bfsp2Q6NVD9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bfsp2Q6NVD9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bfsp2Q6NVD9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bfsp2Q6NVD9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bfsp2Q6NVD9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bfsp2Q6NVD9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bfsp2Q6NVD9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bfsp2Q6NVD9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bfsp2Q6NVD9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bfsp2Q6NVD9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bfsp2Q6NVD9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bfsp2Q6NVD9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bfsp2Q6NVD9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bfsp2Q6NVD9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bfsp2Q6NVD9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Bfsp2Q6NVD9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bfsp2Q6NVD9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bfsp2Q6NVD9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bfsp2Q6NVD9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bfsp2Q6NVD9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bfsp2Q6NVD9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bfsp2Q6NVD9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bfsp2Q6NVD9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Bfsp2Q6NVD9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bfsp2Q6NVD9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bfsp2Q6NVD9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bfsp2Q6NVD9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bfsp2Q6NVD9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bfsp2Q6NVD9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms