Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NipblQ6KCD5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NipblQ6KCD5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NipblQ6KCD5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NipblQ6KCD5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NipblQ6KCD5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NipblQ6KCD5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NipblQ6KCD5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NipblQ6KCD5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NipblQ6KCD5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NipblQ6KCD5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NipblQ6KCD5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NipblQ6KCD5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NipblQ6KCD5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NipblQ6KCD5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NipblQ6KCD5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NipblQ6KCD5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NipblQ6KCD5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NipblQ6KCD5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NipblQ6KCD5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NipblQ6KCD5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NipblQ6KCD5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NipblQ6KCD5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NipblQ6KCD5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NipblQ6KCD5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NipblQ6KCD5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NipblQ6KCD5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NipblQ6KCD5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NipblQ6KCD5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NipblQ6KCD5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NipblQ6KCD5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NipblQ6KCD5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NipblQ6KCD5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NipblQ6KCD5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NipblQ6KCD5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NipblQ6KCD5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NipblQ6KCD5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NipblQ6KCD5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NipblQ6KCD5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NipblQ6KCD5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NipblQ6KCD5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NipblQ6KCD5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NipblQ6KCD5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NipblQ6KCD5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NipblQ6KCD5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NipblQ6KCD5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NipblQ6KCD5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NipblQ6KCD5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NipblQ6KCD5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NipblQ6KCD5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NipblQ6KCD5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NipblQ6KCD5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NipblQ6KCD5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NipblQ6KCD5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NipblQ6KCD5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NipblQ6KCD5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NipblQ6KCD5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NipblQ6KCD5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NipblQ6KCD5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NipblQ6KCD5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NipblQ6KCD5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NipblQ6KCD5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NipblQ6KCD5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NipblQ6KCD5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NipblQ6KCD5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NipblQ6KCD5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NipblQ6KCD5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NipblQ6KCD5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NipblQ6KCD5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NipblQ6KCD5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NipblQ6KCD5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NipblQ6KCD5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NipblQ6KCD5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NipblQ6KCD5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NipblQ6KCD5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NipblQ6KCD5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NipblQ6KCD5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NipblQ6KCD5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NipblQ6KCD5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NipblQ6KCD5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
NipblQ6KCD5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NipblQ6KCD5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms