Protein–RNA interactions for Protein: Q6K1E7

Ggnbp1, Gametogenetin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp1Q6K1E7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ggnbp1Q6K1E7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ggnbp1Q6K1E7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ggnbp1Q6K1E7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ggnbp1Q6K1E7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ggnbp1Q6K1E7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ggnbp1Q6K1E7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ggnbp1Q6K1E7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ggnbp1Q6K1E7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ggnbp1Q6K1E7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ggnbp1Q6K1E7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ggnbp1Q6K1E7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ggnbp1Q6K1E7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ggnbp1Q6K1E7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ggnbp1Q6K1E7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ggnbp1Q6K1E7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ggnbp1Q6K1E7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ggnbp1Q6K1E7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ggnbp1Q6K1E7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ggnbp1Q6K1E7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ggnbp1Q6K1E7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ggnbp1Q6K1E7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ggnbp1Q6K1E7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ggnbp1Q6K1E7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ggnbp1Q6K1E7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ggnbp1Q6K1E7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ggnbp1Q6K1E7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ggnbp1Q6K1E7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ggnbp1Q6K1E7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ggnbp1Q6K1E7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ggnbp1Q6K1E7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ggnbp1Q6K1E7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ggnbp1Q6K1E7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ggnbp1Q6K1E7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ggnbp1Q6K1E7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ggnbp1Q6K1E7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ggnbp1Q6K1E7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ggnbp1Q6K1E7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ggnbp1Q6K1E7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ggnbp1Q6K1E7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ggnbp1Q6K1E7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ggnbp1Q6K1E7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ggnbp1Q6K1E7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ggnbp1Q6K1E7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ggnbp1Q6K1E7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ggnbp1Q6K1E7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ggnbp1Q6K1E7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ggnbp1Q6K1E7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ggnbp1Q6K1E7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ggnbp1Q6K1E7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ggnbp1Q6K1E7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ggnbp1Q6K1E7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ggnbp1Q6K1E7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ggnbp1Q6K1E7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ggnbp1Q6K1E7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ggnbp1Q6K1E7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ggnbp1Q6K1E7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ggnbp1Q6K1E7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ggnbp1Q6K1E7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ggnbp1Q6K1E7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ggnbp1Q6K1E7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ggnbp1Q6K1E7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ggnbp1Q6K1E7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ggnbp1Q6K1E7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ggnbp1Q6K1E7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ggnbp1Q6K1E7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ggnbp1Q6K1E7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ggnbp1Q6K1E7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ggnbp1Q6K1E7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ggnbp1Q6K1E7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ggnbp1Q6K1E7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ggnbp1Q6K1E7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ggnbp1Q6K1E7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ggnbp1Q6K1E7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ggnbp1Q6K1E7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ggnbp1Q6K1E7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ggnbp1Q6K1E7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ggnbp1Q6K1E7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ggnbp1Q6K1E7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ggnbp1Q6K1E7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ggnbp1Q6K1E7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ggnbp1Q6K1E7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ggnbp1Q6K1E7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ggnbp1Q6K1E7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ggnbp1Q6K1E7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ggnbp1Q6K1E7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ggnbp1Q6K1E7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ggnbp1Q6K1E7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ggnbp1Q6K1E7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ggnbp1Q6K1E7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ggnbp1Q6K1E7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ggnbp1Q6K1E7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ggnbp1Q6K1E7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ggnbp1Q6K1E7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ggnbp1Q6K1E7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ggnbp1Q6K1E7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ggnbp1Q6K1E7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ggnbp1Q6K1E7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 616 ms