Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE9

LCN8, Epididymal-specific lipocalin-8, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN8Q6JVE9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCN8Q6JVE9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCN8Q6JVE9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCN8Q6JVE9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCN8Q6JVE9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCN8Q6JVE9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCN8Q6JVE9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCN8Q6JVE9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCN8Q6JVE9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCN8Q6JVE9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCN8Q6JVE9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCN8Q6JVE9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCN8Q6JVE9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCN8Q6JVE9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCN8Q6JVE9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCN8Q6JVE9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCN8Q6JVE9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCN8Q6JVE9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCN8Q6JVE9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCN8Q6JVE9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCN8Q6JVE9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LCN8Q6JVE9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCN8Q6JVE9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCN8Q6JVE9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCN8Q6JVE9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCN8Q6JVE9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCN8Q6JVE9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCN8Q6JVE9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCN8Q6JVE9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCN8Q6JVE9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCN8Q6JVE9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LCN8Q6JVE9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCN8Q6JVE9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LCN8Q6JVE9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCN8Q6JVE9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCN8Q6JVE9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCN8Q6JVE9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCN8Q6JVE9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCN8Q6JVE9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCN8Q6JVE9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCN8Q6JVE9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCN8Q6JVE9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCN8Q6JVE9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCN8Q6JVE9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCN8Q6JVE9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LCN8Q6JVE9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCN8Q6JVE9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCN8Q6JVE9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCN8Q6JVE9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCN8Q6JVE9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCN8Q6JVE9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCN8Q6JVE9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCN8Q6JVE9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCN8Q6JVE9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCN8Q6JVE9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCN8Q6JVE9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCN8Q6JVE9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCN8Q6JVE9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCN8Q6JVE9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCN8Q6JVE9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCN8Q6JVE9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCN8Q6JVE9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCN8Q6JVE9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCN8Q6JVE9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCN8Q6JVE9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCN8Q6JVE9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCN8Q6JVE9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCN8Q6JVE9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCN8Q6JVE9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LCN8Q6JVE9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LCN8Q6JVE9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LCN8Q6JVE9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCN8Q6JVE9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCN8Q6JVE9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LCN8Q6JVE9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCN8Q6JVE9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCN8Q6JVE9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCN8Q6JVE9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCN8Q6JVE9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCN8Q6JVE9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCN8Q6JVE9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCN8Q6JVE9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCN8Q6JVE9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCN8Q6JVE9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCN8Q6JVE9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCN8Q6JVE9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCN8Q6JVE9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCN8Q6JVE9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCN8Q6JVE9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCN8Q6JVE9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCN8Q6JVE9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCN8Q6JVE9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCN8Q6JVE9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCN8Q6JVE9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCN8Q6JVE9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCN8Q6JVE9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCN8Q6JVE9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCN8Q6JVE9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCN8Q6JVE9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCN8Q6JVE9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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