Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD7

Fnip1, Folliculin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fnip1Q68FD7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fnip1Q68FD7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fnip1Q68FD7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Fnip1Q68FD7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Fnip1Q68FD7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fnip1Q68FD7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fnip1Q68FD7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fnip1Q68FD7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fnip1Q68FD7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fnip1Q68FD7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fnip1Q68FD7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fnip1Q68FD7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fnip1Q68FD7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fnip1Q68FD7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fnip1Q68FD7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fnip1Q68FD7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fnip1Q68FD7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fnip1Q68FD7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fnip1Q68FD7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fnip1Q68FD7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fnip1Q68FD7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Fnip1Q68FD7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fnip1Q68FD7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fnip1Q68FD7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fnip1Q68FD7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fnip1Q68FD7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fnip1Q68FD7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fnip1Q68FD7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fnip1Q68FD7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fnip1Q68FD7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fnip1Q68FD7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fnip1Q68FD7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fnip1Q68FD7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fnip1Q68FD7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fnip1Q68FD7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fnip1Q68FD7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fnip1Q68FD7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Fnip1Q68FD7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fnip1Q68FD7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fnip1Q68FD7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Fnip1Q68FD7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fnip1Q68FD7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fnip1Q68FD7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fnip1Q68FD7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fnip1Q68FD7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fnip1Q68FD7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fnip1Q68FD7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fnip1Q68FD7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fnip1Q68FD7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fnip1Q68FD7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Fnip1Q68FD7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fnip1Q68FD7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fnip1Q68FD7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fnip1Q68FD7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fnip1Q68FD7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fnip1Q68FD7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fnip1Q68FD7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fnip1Q68FD7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fnip1Q68FD7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fnip1Q68FD7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fnip1Q68FD7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fnip1Q68FD7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fnip1Q68FD7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fnip1Q68FD7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fnip1Q68FD7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fnip1Q68FD7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fnip1Q68FD7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fnip1Q68FD7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fnip1Q68FD7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fnip1Q68FD7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fnip1Q68FD7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fnip1Q68FD7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fnip1Q68FD7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fnip1Q68FD7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fnip1Q68FD7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fnip1Q68FD7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fnip1Q68FD7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fnip1Q68FD7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fnip1Q68FD7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fnip1Q68FD7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fnip1Q68FD7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fnip1Q68FD7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fnip1Q68FD7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fnip1Q68FD7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fnip1Q68FD7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fnip1Q68FD7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fnip1Q68FD7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fnip1Q68FD7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fnip1Q68FD7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fnip1Q68FD7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fnip1Q68FD7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fnip1Q68FD7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fnip1Q68FD7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fnip1Q68FD7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fnip1Q68FD7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fnip1Q68FD7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fnip1Q68FD7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fnip1Q68FD7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fnip1Q68FD7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fnip1Q68FD7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms