Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nlrp4eQ66X19 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nlrp4eQ66X19 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nlrp4eQ66X19 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nlrp4eQ66X19 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nlrp4eQ66X19 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nlrp4eQ66X19 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nlrp4eQ66X19 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nlrp4eQ66X19 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nlrp4eQ66X19 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlrp4eQ66X19 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlrp4eQ66X19 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlrp4eQ66X19 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlrp4eQ66X19 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlrp4eQ66X19 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlrp4eQ66X19 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlrp4eQ66X19 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlrp4eQ66X19 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlrp4eQ66X19 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlrp4eQ66X19 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlrp4eQ66X19 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlrp4eQ66X19 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlrp4eQ66X19 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlrp4eQ66X19 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlrp4eQ66X19 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlrp4eQ66X19 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlrp4eQ66X19 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlrp4eQ66X19 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlrp4eQ66X19 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlrp4eQ66X19 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlrp4eQ66X19 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlrp4eQ66X19 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlrp4eQ66X19 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Nlrp4eQ66X19 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Nlrp4eQ66X19 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrp4eQ66X19 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrp4eQ66X19 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrp4eQ66X19 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrp4eQ66X19 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrp4eQ66X19 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrp4eQ66X19 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrp4eQ66X19 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrp4eQ66X19 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrp4eQ66X19 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrp4eQ66X19 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrp4eQ66X19 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrp4eQ66X19 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrp4eQ66X19 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrp4eQ66X19 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlrp4eQ66X19 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlrp4eQ66X19 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlrp4eQ66X19 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlrp4eQ66X19 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlrp4eQ66X19 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlrp4eQ66X19 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlrp4eQ66X19 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlrp4eQ66X19 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlrp4eQ66X19 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlrp4eQ66X19 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlrp4eQ66X19 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlrp4eQ66X19 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlrp4eQ66X19 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlrp4eQ66X19 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlrp4eQ66X19 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlrp4eQ66X19 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlrp4eQ66X19 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlrp4eQ66X19 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlrp4eQ66X19 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nlrp4eQ66X19 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nlrp4eQ66X19 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nlrp4eQ66X19 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nlrp4eQ66X19 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nlrp4eQ66X19 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nlrp4eQ66X19 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nlrp4eQ66X19 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nlrp4eQ66X19 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nlrp4eQ66X19 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nlrp4eQ66X19 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Nlrp4eQ66X19 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nlrp4eQ66X19 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nlrp4eQ66X19 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nlrp4eQ66X19 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nlrp4eQ66X19 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nlrp4eQ66X19 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nlrp4eQ66X19 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nlrp4eQ66X19 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nlrp4eQ66X19 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrp4eQ66X19 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrp4eQ66X19 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrp4eQ66X19 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrp4eQ66X19 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrp4eQ66X19 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrp4eQ66X19 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrp4eQ66X19 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrp4eQ66X19 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrp4eQ66X19 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrp4eQ66X19 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrp4eQ66X19 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrp4eQ66X19 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrp4eQ66X19 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms