Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Top2bQ64511 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Top2bQ64511 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Top2bQ64511 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Top2bQ64511 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Top2bQ64511 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Top2bQ64511 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Top2bQ64511 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Top2bQ64511 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Top2bQ64511 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Top2bQ64511 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Top2bQ64511 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Top2bQ64511 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Top2bQ64511 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Top2bQ64511 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Top2bQ64511 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Top2bQ64511 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Top2bQ64511 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Top2bQ64511 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Top2bQ64511 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Top2bQ64511 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Top2bQ64511 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Top2bQ64511 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Top2bQ64511 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
Top2bQ64511 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Top2bQ64511 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Top2bQ64511 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Top2bQ64511 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
Top2bQ64511 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Top2bQ64511 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Top2bQ64511 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Top2bQ64511 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Top2bQ64511 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Top2bQ64511 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
Top2bQ64511 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Top2bQ64511 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Top2bQ64511 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
Top2bQ64511 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Top2bQ64511 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Top2bQ64511 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Top2bQ64511 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Top2bQ64511 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Top2bQ64511 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Top2bQ64511 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Top2bQ64511 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Top2bQ64511 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Top2bQ64511 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Top2bQ64511 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Top2bQ64511 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
Top2bQ64511 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Top2bQ64511 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Top2bQ64511 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Top2bQ64511 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Top2bQ64511 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Top2bQ64511 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Top2bQ64511 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Top2bQ64511 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Top2bQ64511 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Top2bQ64511 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Top2bQ64511 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Top2bQ64511 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Top2bQ64511 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Top2bQ64511 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Top2bQ64511 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Top2bQ64511 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Top2bQ64511 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Top2bQ64511 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Top2bQ64511 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Top2bQ64511 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Top2bQ64511 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Top2bQ64511 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Top2bQ64511 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Top2bQ64511 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Top2bQ64511 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Top2bQ64511 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Top2bQ64511 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Top2bQ64511 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Top2bQ64511 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Top2bQ64511 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Top2bQ64511 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Top2bQ64511 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Top2bQ64511 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Top2bQ64511 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
Top2bQ64511 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Top2bQ64511 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Top2bQ64511 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Top2bQ64511 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Top2bQ64511 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Top2bQ64511 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Top2bQ64511 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Top2bQ64511 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Top2bQ64511 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Top2bQ64511 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Top2bQ64511 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Top2bQ64511 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Top2bQ64511 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Top2bQ64511 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Top2bQ64511 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Top2bQ64511 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Top2bQ64511 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.3 ms