Protein–RNA interactions for Protein: Q62471

Lcn3, Vomeronasal secretory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn3Q62471 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lcn3Q62471 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lcn3Q62471 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lcn3Q62471 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lcn3Q62471 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lcn3Q62471 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lcn3Q62471 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lcn3Q62471 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lcn3Q62471 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lcn3Q62471 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lcn3Q62471 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lcn3Q62471 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lcn3Q62471 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lcn3Q62471 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lcn3Q62471 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lcn3Q62471 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lcn3Q62471 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lcn3Q62471 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lcn3Q62471 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lcn3Q62471 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lcn3Q62471 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lcn3Q62471 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lcn3Q62471 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lcn3Q62471 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lcn3Q62471 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lcn3Q62471 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lcn3Q62471 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lcn3Q62471 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lcn3Q62471 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lcn3Q62471 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lcn3Q62471 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lcn3Q62471 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lcn3Q62471 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lcn3Q62471 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lcn3Q62471 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lcn3Q62471 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lcn3Q62471 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lcn3Q62471 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lcn3Q62471 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lcn3Q62471 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lcn3Q62471 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lcn3Q62471 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lcn3Q62471 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lcn3Q62471 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lcn3Q62471 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lcn3Q62471 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lcn3Q62471 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lcn3Q62471 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lcn3Q62471 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lcn3Q62471 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lcn3Q62471 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lcn3Q62471 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lcn3Q62471 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lcn3Q62471 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lcn3Q62471 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lcn3Q62471 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lcn3Q62471 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lcn3Q62471 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lcn3Q62471 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lcn3Q62471 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lcn3Q62471 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lcn3Q62471 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lcn3Q62471 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lcn3Q62471 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lcn3Q62471 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lcn3Q62471 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lcn3Q62471 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lcn3Q62471 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lcn3Q62471 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lcn3Q62471 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lcn3Q62471 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lcn3Q62471 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lcn3Q62471 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lcn3Q62471 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lcn3Q62471 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lcn3Q62471 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lcn3Q62471 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lcn3Q62471 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lcn3Q62471 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lcn3Q62471 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lcn3Q62471 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lcn3Q62471 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lcn3Q62471 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lcn3Q62471 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lcn3Q62471 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lcn3Q62471 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lcn3Q62471 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lcn3Q62471 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lcn3Q62471 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lcn3Q62471 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lcn3Q62471 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lcn3Q62471 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lcn3Q62471 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lcn3Q62471 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lcn3Q62471 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Lcn3Q62471 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lcn3Q62471 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lcn3Q62471 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lcn3Q62471 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lcn3Q62471 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms