Protein–RNA interactions for Protein: Q62191

Trim21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim21Q62191 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim21Q62191 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim21Q62191 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim21Q62191 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim21Q62191 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim21Q62191 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim21Q62191 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim21Q62191 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim21Q62191 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim21Q62191 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim21Q62191 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim21Q62191 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim21Q62191 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim21Q62191 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim21Q62191 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim21Q62191 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim21Q62191 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim21Q62191 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim21Q62191 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim21Q62191 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim21Q62191 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim21Q62191 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim21Q62191 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim21Q62191 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim21Q62191 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim21Q62191 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim21Q62191 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim21Q62191 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim21Q62191 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim21Q62191 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim21Q62191 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim21Q62191 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim21Q62191 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim21Q62191 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim21Q62191 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim21Q62191 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim21Q62191 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim21Q62191 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim21Q62191 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Trim21Q62191 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Trim21Q62191 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim21Q62191 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim21Q62191 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim21Q62191 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim21Q62191 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim21Q62191 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim21Q62191 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim21Q62191 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim21Q62191 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim21Q62191 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim21Q62191 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim21Q62191 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim21Q62191 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim21Q62191 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim21Q62191 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim21Q62191 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim21Q62191 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim21Q62191 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim21Q62191 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim21Q62191 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim21Q62191 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim21Q62191 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim21Q62191 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim21Q62191 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim21Q62191 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim21Q62191 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim21Q62191 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim21Q62191 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim21Q62191 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim21Q62191 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim21Q62191 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim21Q62191 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim21Q62191 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim21Q62191 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim21Q62191 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim21Q62191 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim21Q62191 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim21Q62191 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim21Q62191 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim21Q62191 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim21Q62191 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim21Q62191 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim21Q62191 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim21Q62191 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim21Q62191 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim21Q62191 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim21Q62191 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim21Q62191 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim21Q62191 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim21Q62191 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim21Q62191 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim21Q62191 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim21Q62191 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim21Q62191 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim21Q62191 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim21Q62191 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim21Q62191 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim21Q62191 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim21Q62191 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim21Q62191 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms