Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SnrpaQ62189 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SnrpaQ62189 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SnrpaQ62189 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SnrpaQ62189 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SnrpaQ62189 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SnrpaQ62189 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SnrpaQ62189 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SnrpaQ62189 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SnrpaQ62189 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SnrpaQ62189 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SnrpaQ62189 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SnrpaQ62189 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SnrpaQ62189 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SnrpaQ62189 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SnrpaQ62189 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SnrpaQ62189 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SnrpaQ62189 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SnrpaQ62189 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SnrpaQ62189 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SnrpaQ62189 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SnrpaQ62189 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SnrpaQ62189 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SnrpaQ62189 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SnrpaQ62189 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SnrpaQ62189 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SnrpaQ62189 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SnrpaQ62189 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SnrpaQ62189 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SnrpaQ62189 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SnrpaQ62189 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SnrpaQ62189 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SnrpaQ62189 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SnrpaQ62189 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SnrpaQ62189 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SnrpaQ62189 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SnrpaQ62189 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SnrpaQ62189 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SnrpaQ62189 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SnrpaQ62189 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SnrpaQ62189 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SnrpaQ62189 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SnrpaQ62189 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SnrpaQ62189 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SnrpaQ62189 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SnrpaQ62189 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SnrpaQ62189 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SnrpaQ62189 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SnrpaQ62189 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SnrpaQ62189 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SnrpaQ62189 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SnrpaQ62189 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SnrpaQ62189 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SnrpaQ62189 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SnrpaQ62189 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SnrpaQ62189 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SnrpaQ62189 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SnrpaQ62189 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SnrpaQ62189 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SnrpaQ62189 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SnrpaQ62189 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SnrpaQ62189 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SnrpaQ62189 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SnrpaQ62189 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SnrpaQ62189 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SnrpaQ62189 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SnrpaQ62189 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SnrpaQ62189 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SnrpaQ62189 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SnrpaQ62189 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SnrpaQ62189 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SnrpaQ62189 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SnrpaQ62189 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SnrpaQ62189 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SnrpaQ62189 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SnrpaQ62189 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SnrpaQ62189 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SnrpaQ62189 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SnrpaQ62189 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SnrpaQ62189 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SnrpaQ62189 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SnrpaQ62189 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SnrpaQ62189 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SnrpaQ62189 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SnrpaQ62189 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SnrpaQ62189 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SnrpaQ62189 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SnrpaQ62189 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SnrpaQ62189 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SnrpaQ62189 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SnrpaQ62189 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SnrpaQ62189 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SnrpaQ62189 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SnrpaQ62189 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SnrpaQ62189 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SnrpaQ62189 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SnrpaQ62189 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SnrpaQ62189 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SnrpaQ62189 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SnrpaQ62189 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms