Protein–RNA interactions for Protein: Q61249

Igbp1, Immunoglobulin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igbp1Q61249 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Igbp1Q61249 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Igbp1Q61249 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Igbp1Q61249 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Igbp1Q61249 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Igbp1Q61249 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Igbp1Q61249 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Igbp1Q61249 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Igbp1Q61249 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Igbp1Q61249 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Igbp1Q61249 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Igbp1Q61249 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Igbp1Q61249 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Igbp1Q61249 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Igbp1Q61249 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Igbp1Q61249 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Igbp1Q61249 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Igbp1Q61249 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Igbp1Q61249 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Igbp1Q61249 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Igbp1Q61249 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Igbp1Q61249 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Igbp1Q61249 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Igbp1Q61249 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Igbp1Q61249 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Igbp1Q61249 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Igbp1Q61249 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Igbp1Q61249 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Igbp1Q61249 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Igbp1Q61249 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Igbp1Q61249 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Igbp1Q61249 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Igbp1Q61249 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Igbp1Q61249 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Igbp1Q61249 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Igbp1Q61249 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Igbp1Q61249 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Igbp1Q61249 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Igbp1Q61249 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Igbp1Q61249 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Igbp1Q61249 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Igbp1Q61249 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Igbp1Q61249 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Igbp1Q61249 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Igbp1Q61249 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Igbp1Q61249 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Igbp1Q61249 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Igbp1Q61249 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Igbp1Q61249 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Igbp1Q61249 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Igbp1Q61249 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Igbp1Q61249 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Igbp1Q61249 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Igbp1Q61249 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Igbp1Q61249 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Igbp1Q61249 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Igbp1Q61249 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Igbp1Q61249 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Igbp1Q61249 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Igbp1Q61249 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Igbp1Q61249 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Igbp1Q61249 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Igbp1Q61249 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Igbp1Q61249 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Igbp1Q61249 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Igbp1Q61249 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Igbp1Q61249 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Igbp1Q61249 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Igbp1Q61249 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Igbp1Q61249 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Igbp1Q61249 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Igbp1Q61249 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Igbp1Q61249 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Igbp1Q61249 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Igbp1Q61249 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Igbp1Q61249 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Igbp1Q61249 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Igbp1Q61249 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Igbp1Q61249 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Igbp1Q61249 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Igbp1Q61249 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Igbp1Q61249 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Igbp1Q61249 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Igbp1Q61249 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Igbp1Q61249 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Igbp1Q61249 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Igbp1Q61249 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Igbp1Q61249 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Igbp1Q61249 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Igbp1Q61249 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Igbp1Q61249 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Igbp1Q61249 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Igbp1Q61249 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Igbp1Q61249 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Igbp1Q61249 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Igbp1Q61249 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Igbp1Q61249 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Igbp1Q61249 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Igbp1Q61249 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Igbp1Q61249 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms