Protein–RNA interactions for Protein: Q61003

Cd6, T-cell differentiation antigen CD6, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd6Q61003 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd6Q61003 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd6Q61003 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd6Q61003 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd6Q61003 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd6Q61003 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd6Q61003 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd6Q61003 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd6Q61003 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd6Q61003 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd6Q61003 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd6Q61003 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd6Q61003 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd6Q61003 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd6Q61003 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd6Q61003 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd6Q61003 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd6Q61003 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd6Q61003 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd6Q61003 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd6Q61003 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd6Q61003 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd6Q61003 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd6Q61003 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd6Q61003 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd6Q61003 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd6Q61003 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd6Q61003 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd6Q61003 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd6Q61003 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd6Q61003 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd6Q61003 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd6Q61003 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd6Q61003 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd6Q61003 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd6Q61003 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd6Q61003 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd6Q61003 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd6Q61003 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd6Q61003 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd6Q61003 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd6Q61003 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cd6Q61003 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd6Q61003 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd6Q61003 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd6Q61003 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd6Q61003 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd6Q61003 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd6Q61003 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd6Q61003 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd6Q61003 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd6Q61003 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd6Q61003 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd6Q61003 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd6Q61003 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd6Q61003 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd6Q61003 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd6Q61003 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd6Q61003 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd6Q61003 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd6Q61003 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd6Q61003 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd6Q61003 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd6Q61003 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd6Q61003 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd6Q61003 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd6Q61003 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd6Q61003 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd6Q61003 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd6Q61003 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd6Q61003 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd6Q61003 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd6Q61003 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd6Q61003 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd6Q61003 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd6Q61003 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd6Q61003 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd6Q61003 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd6Q61003 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd6Q61003 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd6Q61003 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd6Q61003 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd6Q61003 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd6Q61003 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd6Q61003 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd6Q61003 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd6Q61003 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd6Q61003 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd6Q61003 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd6Q61003 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd6Q61003 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd6Q61003 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd6Q61003 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd6Q61003 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd6Q61003 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd6Q61003 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd6Q61003 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd6Q61003 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd6Q61003 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd6Q61003 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms