Protein–RNA interactions for Protein: Q5XKE5

KRT79, Keratin, type II cytoskeletal 79, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT79Q5XKE5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT79Q5XKE5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT79Q5XKE5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT79Q5XKE5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT79Q5XKE5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT79Q5XKE5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT79Q5XKE5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT79Q5XKE5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT79Q5XKE5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT79Q5XKE5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT79Q5XKE5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT79Q5XKE5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT79Q5XKE5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT79Q5XKE5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT79Q5XKE5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT79Q5XKE5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT79Q5XKE5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT79Q5XKE5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT79Q5XKE5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT79Q5XKE5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT79Q5XKE5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT79Q5XKE5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT79Q5XKE5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT79Q5XKE5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT79Q5XKE5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT79Q5XKE5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KRT79Q5XKE5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
KRT79Q5XKE5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KRT79Q5XKE5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
KRT79Q5XKE5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
KRT79Q5XKE5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT79Q5XKE5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT79Q5XKE5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT79Q5XKE5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT79Q5XKE5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT79Q5XKE5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT79Q5XKE5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT79Q5XKE5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT79Q5XKE5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT79Q5XKE5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT79Q5XKE5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT79Q5XKE5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT79Q5XKE5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT79Q5XKE5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT79Q5XKE5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT79Q5XKE5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT79Q5XKE5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT79Q5XKE5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT79Q5XKE5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT79Q5XKE5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT79Q5XKE5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT79Q5XKE5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT79Q5XKE5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT79Q5XKE5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT79Q5XKE5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT79Q5XKE5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT79Q5XKE5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT79Q5XKE5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT79Q5XKE5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT79Q5XKE5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT79Q5XKE5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT79Q5XKE5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT79Q5XKE5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT79Q5XKE5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT79Q5XKE5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT79Q5XKE5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT79Q5XKE5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT79Q5XKE5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT79Q5XKE5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT79Q5XKE5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT79Q5XKE5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
KRT79Q5XKE5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT79Q5XKE5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT79Q5XKE5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT79Q5XKE5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT79Q5XKE5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT79Q5XKE5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT79Q5XKE5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT79Q5XKE5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT79Q5XKE5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT79Q5XKE5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT79Q5XKE5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT79Q5XKE5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT79Q5XKE5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT79Q5XKE5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT79Q5XKE5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT79Q5XKE5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT79Q5XKE5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT79Q5XKE5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT79Q5XKE5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT79Q5XKE5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT79Q5XKE5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT79Q5XKE5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT79Q5XKE5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT79Q5XKE5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT79Q5XKE5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT79Q5XKE5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT79Q5XKE5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT79Q5XKE5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT79Q5XKE5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms