Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP3

MLIP, Muscular LMNA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLIPQ5VWP3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MLIPQ5VWP3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MLIPQ5VWP3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MLIPQ5VWP3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MLIPQ5VWP3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MLIPQ5VWP3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MLIPQ5VWP3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MLIPQ5VWP3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MLIPQ5VWP3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MLIPQ5VWP3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MLIPQ5VWP3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MLIPQ5VWP3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MLIPQ5VWP3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MLIPQ5VWP3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MLIPQ5VWP3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MLIPQ5VWP3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MLIPQ5VWP3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MLIPQ5VWP3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MLIPQ5VWP3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MLIPQ5VWP3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MLIPQ5VWP3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MLIPQ5VWP3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MLIPQ5VWP3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MLIPQ5VWP3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MLIPQ5VWP3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MLIPQ5VWP3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MLIPQ5VWP3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MLIPQ5VWP3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MLIPQ5VWP3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MLIPQ5VWP3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MLIPQ5VWP3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MLIPQ5VWP3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MLIPQ5VWP3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MLIPQ5VWP3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MLIPQ5VWP3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MLIPQ5VWP3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MLIPQ5VWP3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MLIPQ5VWP3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MLIPQ5VWP3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MLIPQ5VWP3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MLIPQ5VWP3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MLIPQ5VWP3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MLIPQ5VWP3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MLIPQ5VWP3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MLIPQ5VWP3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MLIPQ5VWP3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MLIPQ5VWP3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MLIPQ5VWP3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MLIPQ5VWP3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MLIPQ5VWP3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MLIPQ5VWP3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MLIPQ5VWP3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MLIPQ5VWP3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MLIPQ5VWP3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MLIPQ5VWP3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MLIPQ5VWP3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MLIPQ5VWP3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MLIPQ5VWP3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MLIPQ5VWP3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MLIPQ5VWP3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MLIPQ5VWP3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MLIPQ5VWP3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MLIPQ5VWP3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MLIPQ5VWP3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MLIPQ5VWP3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MLIPQ5VWP3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MLIPQ5VWP3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MLIPQ5VWP3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MLIPQ5VWP3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MLIPQ5VWP3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MLIPQ5VWP3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MLIPQ5VWP3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MLIPQ5VWP3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MLIPQ5VWP3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MLIPQ5VWP3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MLIPQ5VWP3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MLIPQ5VWP3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MLIPQ5VWP3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MLIPQ5VWP3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MLIPQ5VWP3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MLIPQ5VWP3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MLIPQ5VWP3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MLIPQ5VWP3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MLIPQ5VWP3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MLIPQ5VWP3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MLIPQ5VWP3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MLIPQ5VWP3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MLIPQ5VWP3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MLIPQ5VWP3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MLIPQ5VWP3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MLIPQ5VWP3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MLIPQ5VWP3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MLIPQ5VWP3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MLIPQ5VWP3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MLIPQ5VWP3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MLIPQ5VWP3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MLIPQ5VWP3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MLIPQ5VWP3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MLIPQ5VWP3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MLIPQ5VWP3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms