Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF20Q5VT98 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF20Q5VT98 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.7 ms