Protein–RNA interactions for Protein: Q5T619

ZNF648, Zinc finger protein 648, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF648Q5T619 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF648Q5T619 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF648Q5T619 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF648Q5T619 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF648Q5T619 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF648Q5T619 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF648Q5T619 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF648Q5T619 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF648Q5T619 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF648Q5T619 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF648Q5T619 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF648Q5T619 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF648Q5T619 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF648Q5T619 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ZNF648Q5T619 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF648Q5T619 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF648Q5T619 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF648Q5T619 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF648Q5T619 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF648Q5T619 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF648Q5T619 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF648Q5T619 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF648Q5T619 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF648Q5T619 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF648Q5T619 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF648Q5T619 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF648Q5T619 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF648Q5T619 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF648Q5T619 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF648Q5T619 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF648Q5T619 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF648Q5T619 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF648Q5T619 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF648Q5T619 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF648Q5T619 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF648Q5T619 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF648Q5T619 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF648Q5T619 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF648Q5T619 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF648Q5T619 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF648Q5T619 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF648Q5T619 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF648Q5T619 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF648Q5T619 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF648Q5T619 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF648Q5T619 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF648Q5T619 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF648Q5T619 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF648Q5T619 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF648Q5T619 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF648Q5T619 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF648Q5T619 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF648Q5T619 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF648Q5T619 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF648Q5T619 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF648Q5T619 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF648Q5T619 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF648Q5T619 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF648Q5T619 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF648Q5T619 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF648Q5T619 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF648Q5T619 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF648Q5T619 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms