Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CC2D1BQ5T0F9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CC2D1BQ5T0F9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CC2D1BQ5T0F9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CC2D1BQ5T0F9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CC2D1BQ5T0F9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CC2D1BQ5T0F9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
CC2D1BQ5T0F9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CC2D1BQ5T0F9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CC2D1BQ5T0F9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CC2D1BQ5T0F9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CC2D1BQ5T0F9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CC2D1BQ5T0F9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CC2D1BQ5T0F9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.73
CC2D1BQ5T0F9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CC2D1BQ5T0F9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CC2D1BQ5T0F9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CC2D1BQ5T0F9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
CC2D1BQ5T0F9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CC2D1BQ5T0F9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CC2D1BQ5T0F9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CC2D1BQ5T0F9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CC2D1BQ5T0F9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
CC2D1BQ5T0F9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
CC2D1BQ5T0F9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CC2D1BQ5T0F9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CC2D1BQ5T0F9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CC2D1BQ5T0F9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CC2D1BQ5T0F9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CC2D1BQ5T0F9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CC2D1BQ5T0F9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CC2D1BQ5T0F9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CC2D1BQ5T0F9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CC2D1BQ5T0F9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CC2D1BQ5T0F9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CC2D1BQ5T0F9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CC2D1BQ5T0F9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CC2D1BQ5T0F9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CC2D1BQ5T0F9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CC2D1BQ5T0F9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CC2D1BQ5T0F9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CC2D1BQ5T0F9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CC2D1BQ5T0F9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CC2D1BQ5T0F9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
CC2D1BQ5T0F9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CC2D1BQ5T0F9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CC2D1BQ5T0F9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CC2D1BQ5T0F9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CC2D1BQ5T0F9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CC2D1BQ5T0F9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CC2D1BQ5T0F9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CC2D1BQ5T0F9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CC2D1BQ5T0F9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CC2D1BQ5T0F9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
CC2D1BQ5T0F9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CC2D1BQ5T0F9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CC2D1BQ5T0F9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
CC2D1BQ5T0F9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
CC2D1BQ5T0F9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CC2D1BQ5T0F9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CC2D1BQ5T0F9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CC2D1BQ5T0F9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CC2D1BQ5T0F9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CC2D1BQ5T0F9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
CC2D1BQ5T0F9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CC2D1BQ5T0F9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CC2D1BQ5T0F9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CC2D1BQ5T0F9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CC2D1BQ5T0F9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CC2D1BQ5T0F9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
CC2D1BQ5T0F9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CC2D1BQ5T0F9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CC2D1BQ5T0F9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CC2D1BQ5T0F9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
CC2D1BQ5T0F9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CC2D1BQ5T0F9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CC2D1BQ5T0F9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CC2D1BQ5T0F9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CC2D1BQ5T0F9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CC2D1BQ5T0F9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
CC2D1BQ5T0F9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
CC2D1BQ5T0F9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CC2D1BQ5T0F9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
CC2D1BQ5T0F9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
CC2D1BQ5T0F9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CC2D1BQ5T0F9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CC2D1BQ5T0F9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CC2D1BQ5T0F9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CC2D1BQ5T0F9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CC2D1BQ5T0F9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CC2D1BQ5T0F9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CC2D1BQ5T0F9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
CC2D1BQ5T0F9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CC2D1BQ5T0F9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CC2D1BQ5T0F9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CC2D1BQ5T0F9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CC2D1BQ5T0F9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
CC2D1BQ5T0F9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CC2D1BQ5T0F9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CC2D1BQ5T0F9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms