Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXY1

Specc1, Cytospin-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1Q5SXY1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Specc1Q5SXY1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Specc1Q5SXY1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Specc1Q5SXY1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Specc1Q5SXY1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Specc1Q5SXY1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Specc1Q5SXY1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Specc1Q5SXY1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Specc1Q5SXY1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Specc1Q5SXY1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Specc1Q5SXY1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Specc1Q5SXY1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Specc1Q5SXY1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Specc1Q5SXY1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Specc1Q5SXY1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Specc1Q5SXY1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Specc1Q5SXY1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Specc1Q5SXY1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Specc1Q5SXY1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Specc1Q5SXY1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Specc1Q5SXY1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Specc1Q5SXY1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Specc1Q5SXY1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Specc1Q5SXY1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Specc1Q5SXY1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Specc1Q5SXY1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Specc1Q5SXY1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Specc1Q5SXY1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Specc1Q5SXY1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Specc1Q5SXY1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Specc1Q5SXY1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Specc1Q5SXY1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Specc1Q5SXY1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Specc1Q5SXY1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Specc1Q5SXY1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Specc1Q5SXY1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Specc1Q5SXY1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Specc1Q5SXY1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Specc1Q5SXY1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Specc1Q5SXY1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Specc1Q5SXY1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Specc1Q5SXY1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Specc1Q5SXY1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Specc1Q5SXY1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Specc1Q5SXY1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Specc1Q5SXY1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Specc1Q5SXY1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Specc1Q5SXY1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Specc1Q5SXY1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Specc1Q5SXY1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Specc1Q5SXY1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Specc1Q5SXY1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Specc1Q5SXY1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Specc1Q5SXY1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Specc1Q5SXY1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Specc1Q5SXY1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Specc1Q5SXY1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Specc1Q5SXY1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Specc1Q5SXY1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Specc1Q5SXY1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Specc1Q5SXY1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Specc1Q5SXY1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Specc1Q5SXY1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Specc1Q5SXY1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Specc1Q5SXY1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Specc1Q5SXY1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Specc1Q5SXY1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Specc1Q5SXY1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Specc1Q5SXY1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Specc1Q5SXY1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Specc1Q5SXY1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Specc1Q5SXY1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Specc1Q5SXY1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Specc1Q5SXY1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Specc1Q5SXY1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Specc1Q5SXY1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Specc1Q5SXY1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Specc1Q5SXY1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Specc1Q5SXY1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Specc1Q5SXY1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Specc1Q5SXY1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Specc1Q5SXY1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Specc1Q5SXY1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Specc1Q5SXY1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Specc1Q5SXY1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Specc1Q5SXY1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Specc1Q5SXY1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Specc1Q5SXY1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Specc1Q5SXY1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Specc1Q5SXY1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Specc1Q5SXY1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Specc1Q5SXY1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Specc1Q5SXY1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Specc1Q5SXY1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Specc1Q5SXY1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Specc1Q5SXY1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Specc1Q5SXY1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Specc1Q5SXY1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Specc1Q5SXY1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Specc1Q5SXY1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169.1 ms