Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW19

Cluh, Clustered mitochondria protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluhQ5SW19 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CluhQ5SW19 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CluhQ5SW19 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CluhQ5SW19 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CluhQ5SW19 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CluhQ5SW19 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CluhQ5SW19 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CluhQ5SW19 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CluhQ5SW19 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CluhQ5SW19 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CluhQ5SW19 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CluhQ5SW19 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CluhQ5SW19 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CluhQ5SW19 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CluhQ5SW19 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CluhQ5SW19 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CluhQ5SW19 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CluhQ5SW19 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CluhQ5SW19 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CluhQ5SW19 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CluhQ5SW19 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CluhQ5SW19 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CluhQ5SW19 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CluhQ5SW19 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CluhQ5SW19 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CluhQ5SW19 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CluhQ5SW19 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CluhQ5SW19 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CluhQ5SW19 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CluhQ5SW19 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CluhQ5SW19 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CluhQ5SW19 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CluhQ5SW19 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CluhQ5SW19 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CluhQ5SW19 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CluhQ5SW19 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CluhQ5SW19 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CluhQ5SW19 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CluhQ5SW19 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CluhQ5SW19 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CluhQ5SW19 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CluhQ5SW19 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CluhQ5SW19 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CluhQ5SW19 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CluhQ5SW19 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CluhQ5SW19 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CluhQ5SW19 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CluhQ5SW19 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CluhQ5SW19 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CluhQ5SW19 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CluhQ5SW19 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CluhQ5SW19 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CluhQ5SW19 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CluhQ5SW19 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CluhQ5SW19 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CluhQ5SW19 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CluhQ5SW19 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CluhQ5SW19 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CluhQ5SW19 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CluhQ5SW19 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CluhQ5SW19 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CluhQ5SW19 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CluhQ5SW19 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CluhQ5SW19 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CluhQ5SW19 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CluhQ5SW19 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CluhQ5SW19 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CluhQ5SW19 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CluhQ5SW19 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CluhQ5SW19 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CluhQ5SW19 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CluhQ5SW19 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CluhQ5SW19 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CluhQ5SW19 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CluhQ5SW19 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CluhQ5SW19 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CluhQ5SW19 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CluhQ5SW19 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CluhQ5SW19 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CluhQ5SW19 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CluhQ5SW19 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CluhQ5SW19 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CluhQ5SW19 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CluhQ5SW19 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CluhQ5SW19 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CluhQ5SW19 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CluhQ5SW19 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CluhQ5SW19 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CluhQ5SW19 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CluhQ5SW19 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CluhQ5SW19 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CluhQ5SW19 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CluhQ5SW19 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CluhQ5SW19 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CluhQ5SW19 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CluhQ5SW19 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CluhQ5SW19 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CluhQ5SW19 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CluhQ5SW19 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CluhQ5SW19 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.5 ms