Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCI0

Urgcp, Up-regulator of cell proliferation, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UrgcpQ5NCI0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UrgcpQ5NCI0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UrgcpQ5NCI0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UrgcpQ5NCI0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UrgcpQ5NCI0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UrgcpQ5NCI0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UrgcpQ5NCI0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UrgcpQ5NCI0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UrgcpQ5NCI0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UrgcpQ5NCI0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UrgcpQ5NCI0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UrgcpQ5NCI0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UrgcpQ5NCI0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UrgcpQ5NCI0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UrgcpQ5NCI0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UrgcpQ5NCI0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UrgcpQ5NCI0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UrgcpQ5NCI0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
UrgcpQ5NCI0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UrgcpQ5NCI0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UrgcpQ5NCI0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UrgcpQ5NCI0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UrgcpQ5NCI0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
UrgcpQ5NCI0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UrgcpQ5NCI0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UrgcpQ5NCI0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UrgcpQ5NCI0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UrgcpQ5NCI0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UrgcpQ5NCI0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UrgcpQ5NCI0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UrgcpQ5NCI0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UrgcpQ5NCI0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UrgcpQ5NCI0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UrgcpQ5NCI0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UrgcpQ5NCI0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UrgcpQ5NCI0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UrgcpQ5NCI0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UrgcpQ5NCI0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UrgcpQ5NCI0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UrgcpQ5NCI0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UrgcpQ5NCI0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UrgcpQ5NCI0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UrgcpQ5NCI0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UrgcpQ5NCI0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UrgcpQ5NCI0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UrgcpQ5NCI0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UrgcpQ5NCI0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UrgcpQ5NCI0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UrgcpQ5NCI0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UrgcpQ5NCI0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UrgcpQ5NCI0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UrgcpQ5NCI0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UrgcpQ5NCI0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UrgcpQ5NCI0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UrgcpQ5NCI0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UrgcpQ5NCI0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UrgcpQ5NCI0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UrgcpQ5NCI0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UrgcpQ5NCI0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UrgcpQ5NCI0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UrgcpQ5NCI0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UrgcpQ5NCI0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UrgcpQ5NCI0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UrgcpQ5NCI0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UrgcpQ5NCI0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UrgcpQ5NCI0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UrgcpQ5NCI0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UrgcpQ5NCI0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UrgcpQ5NCI0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UrgcpQ5NCI0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UrgcpQ5NCI0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UrgcpQ5NCI0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UrgcpQ5NCI0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UrgcpQ5NCI0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UrgcpQ5NCI0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UrgcpQ5NCI0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UrgcpQ5NCI0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UrgcpQ5NCI0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UrgcpQ5NCI0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UrgcpQ5NCI0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UrgcpQ5NCI0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UrgcpQ5NCI0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UrgcpQ5NCI0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UrgcpQ5NCI0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UrgcpQ5NCI0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UrgcpQ5NCI0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UrgcpQ5NCI0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UrgcpQ5NCI0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UrgcpQ5NCI0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UrgcpQ5NCI0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UrgcpQ5NCI0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UrgcpQ5NCI0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UrgcpQ5NCI0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UrgcpQ5NCI0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UrgcpQ5NCI0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UrgcpQ5NCI0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UrgcpQ5NCI0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UrgcpQ5NCI0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UrgcpQ5NCI0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UrgcpQ5NCI0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms