Protein–RNA interactions for Protein: Q5JS37

NHLRC3, NHL repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC3Q5JS37 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NHLRC3Q5JS37 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NHLRC3Q5JS37 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NHLRC3Q5JS37 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NHLRC3Q5JS37 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NHLRC3Q5JS37 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NHLRC3Q5JS37 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NHLRC3Q5JS37 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NHLRC3Q5JS37 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NHLRC3Q5JS37 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NHLRC3Q5JS37 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NHLRC3Q5JS37 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NHLRC3Q5JS37 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NHLRC3Q5JS37 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NHLRC3Q5JS37 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NHLRC3Q5JS37 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NHLRC3Q5JS37 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NHLRC3Q5JS37 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NHLRC3Q5JS37 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NHLRC3Q5JS37 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NHLRC3Q5JS37 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NHLRC3Q5JS37 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NHLRC3Q5JS37 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NHLRC3Q5JS37 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NHLRC3Q5JS37 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NHLRC3Q5JS37 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NHLRC3Q5JS37 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NHLRC3Q5JS37 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NHLRC3Q5JS37 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NHLRC3Q5JS37 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NHLRC3Q5JS37 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NHLRC3Q5JS37 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NHLRC3Q5JS37 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NHLRC3Q5JS37 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NHLRC3Q5JS37 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NHLRC3Q5JS37 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NHLRC3Q5JS37 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NHLRC3Q5JS37 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NHLRC3Q5JS37 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NHLRC3Q5JS37 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NHLRC3Q5JS37 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NHLRC3Q5JS37 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NHLRC3Q5JS37 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NHLRC3Q5JS37 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NHLRC3Q5JS37 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NHLRC3Q5JS37 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NHLRC3Q5JS37 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NHLRC3Q5JS37 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NHLRC3Q5JS37 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NHLRC3Q5JS37 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NHLRC3Q5JS37 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NHLRC3Q5JS37 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NHLRC3Q5JS37 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NHLRC3Q5JS37 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NHLRC3Q5JS37 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NHLRC3Q5JS37 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NHLRC3Q5JS37 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NHLRC3Q5JS37 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NHLRC3Q5JS37 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NHLRC3Q5JS37 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NHLRC3Q5JS37 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NHLRC3Q5JS37 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NHLRC3Q5JS37 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NHLRC3Q5JS37 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NHLRC3Q5JS37 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NHLRC3Q5JS37 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NHLRC3Q5JS37 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NHLRC3Q5JS37 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NHLRC3Q5JS37 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NHLRC3Q5JS37 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NHLRC3Q5JS37 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NHLRC3Q5JS37 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NHLRC3Q5JS37 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NHLRC3Q5JS37 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NHLRC3Q5JS37 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NHLRC3Q5JS37 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NHLRC3Q5JS37 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NHLRC3Q5JS37 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NHLRC3Q5JS37 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NHLRC3Q5JS37 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NHLRC3Q5JS37 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NHLRC3Q5JS37 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NHLRC3Q5JS37 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NHLRC3Q5JS37 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NHLRC3Q5JS37 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NHLRC3Q5JS37 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NHLRC3Q5JS37 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NHLRC3Q5JS37 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NHLRC3Q5JS37 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NHLRC3Q5JS37 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NHLRC3Q5JS37 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NHLRC3Q5JS37 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NHLRC3Q5JS37 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NHLRC3Q5JS37 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NHLRC3Q5JS37 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NHLRC3Q5JS37 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NHLRC3Q5JS37 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NHLRC3Q5JS37 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NHLRC3Q5JS37 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NHLRC3Q5JS37 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms