Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trpm3Q5F4S9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trpm3Q5F4S9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Trpm3Q5F4S9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trpm3Q5F4S9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trpm3Q5F4S9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trpm3Q5F4S9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Trpm3Q5F4S9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trpm3Q5F4S9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trpm3Q5F4S9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trpm3Q5F4S9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trpm3Q5F4S9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trpm3Q5F4S9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trpm3Q5F4S9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trpm3Q5F4S9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trpm3Q5F4S9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trpm3Q5F4S9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trpm3Q5F4S9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trpm3Q5F4S9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trpm3Q5F4S9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trpm3Q5F4S9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trpm3Q5F4S9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trpm3Q5F4S9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trpm3Q5F4S9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trpm3Q5F4S9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Trpm3Q5F4S9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Trpm3Q5F4S9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Trpm3Q5F4S9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Trpm3Q5F4S9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Trpm3Q5F4S9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trpm3Q5F4S9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trpm3Q5F4S9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trpm3Q5F4S9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Trpm3Q5F4S9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trpm3Q5F4S9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trpm3Q5F4S9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trpm3Q5F4S9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trpm3Q5F4S9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trpm3Q5F4S9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trpm3Q5F4S9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trpm3Q5F4S9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trpm3Q5F4S9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trpm3Q5F4S9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trpm3Q5F4S9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trpm3Q5F4S9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trpm3Q5F4S9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trpm3Q5F4S9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trpm3Q5F4S9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trpm3Q5F4S9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trpm3Q5F4S9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trpm3Q5F4S9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trpm3Q5F4S9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trpm3Q5F4S9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trpm3Q5F4S9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trpm3Q5F4S9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trpm3Q5F4S9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trpm3Q5F4S9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trpm3Q5F4S9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trpm3Q5F4S9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trpm3Q5F4S9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Trpm3Q5F4S9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Trpm3Q5F4S9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Trpm3Q5F4S9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Trpm3Q5F4S9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Trpm3Q5F4S9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trpm3Q5F4S9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trpm3Q5F4S9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trpm3Q5F4S9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trpm3Q5F4S9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trpm3Q5F4S9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trpm3Q5F4S9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trpm3Q5F4S9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trpm3Q5F4S9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trpm3Q5F4S9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trpm3Q5F4S9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trpm3Q5F4S9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trpm3Q5F4S9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trpm3Q5F4S9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trpm3Q5F4S9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trpm3Q5F4S9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trpm3Q5F4S9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trpm3Q5F4S9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trpm3Q5F4S9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trpm3Q5F4S9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trpm3Q5F4S9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trpm3Q5F4S9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trpm3Q5F4S9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trpm3Q5F4S9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trpm3Q5F4S9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trpm3Q5F4S9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Trpm3Q5F4S9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trpm3Q5F4S9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trpm3Q5F4S9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trpm3Q5F4S9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trpm3Q5F4S9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trpm3Q5F4S9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Trpm3Q5F4S9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trpm3Q5F4S9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trpm3Q5F4S9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Trpm3Q5F4S9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms