Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ODF2Q5BJF6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ODF2Q5BJF6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ODF2Q5BJF6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ODF2Q5BJF6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ODF2Q5BJF6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ODF2Q5BJF6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ODF2Q5BJF6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ODF2Q5BJF6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ODF2Q5BJF6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ODF2Q5BJF6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ODF2Q5BJF6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ODF2Q5BJF6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ODF2Q5BJF6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ODF2Q5BJF6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ODF2Q5BJF6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ODF2Q5BJF6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ODF2Q5BJF6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ODF2Q5BJF6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ODF2Q5BJF6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ODF2Q5BJF6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ODF2Q5BJF6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ODF2Q5BJF6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ODF2Q5BJF6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ODF2Q5BJF6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ODF2Q5BJF6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ODF2Q5BJF6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ODF2Q5BJF6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ODF2Q5BJF6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ODF2Q5BJF6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ODF2Q5BJF6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ODF2Q5BJF6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ODF2Q5BJF6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ODF2Q5BJF6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ODF2Q5BJF6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ODF2Q5BJF6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ODF2Q5BJF6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ODF2Q5BJF6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ODF2Q5BJF6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ODF2Q5BJF6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ODF2Q5BJF6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ODF2Q5BJF6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ODF2Q5BJF6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ODF2Q5BJF6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ODF2Q5BJF6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ODF2Q5BJF6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ODF2Q5BJF6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ODF2Q5BJF6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ODF2Q5BJF6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ODF2Q5BJF6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ODF2Q5BJF6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ODF2Q5BJF6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ODF2Q5BJF6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ODF2Q5BJF6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ODF2Q5BJF6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ODF2Q5BJF6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ODF2Q5BJF6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ODF2Q5BJF6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ODF2Q5BJF6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ODF2Q5BJF6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ODF2Q5BJF6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ODF2Q5BJF6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ODF2Q5BJF6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ODF2Q5BJF6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ODF2Q5BJF6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ODF2Q5BJF6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ODF2Q5BJF6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ODF2Q5BJF6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ODF2Q5BJF6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ODF2Q5BJF6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ODF2Q5BJF6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ODF2Q5BJF6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ODF2Q5BJF6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ODF2Q5BJF6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ODF2Q5BJF6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ODF2Q5BJF6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ODF2Q5BJF6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ODF2Q5BJF6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ODF2Q5BJF6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ODF2Q5BJF6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ODF2Q5BJF6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ODF2Q5BJF6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ODF2Q5BJF6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ODF2Q5BJF6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ODF2Q5BJF6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ODF2Q5BJF6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ODF2Q5BJF6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ODF2Q5BJF6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ODF2Q5BJF6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ODF2Q5BJF6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ODF2Q5BJF6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ODF2Q5BJF6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ODF2Q5BJF6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ODF2Q5BJF6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ODF2Q5BJF6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ODF2Q5BJF6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ODF2Q5BJF6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ODF2Q5BJF6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ODF2Q5BJF6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ODF2Q5BJF6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms