Protein–RNA interactions for Protein: Q52KI8

Srrm1, Serine/arginine repetitive matrix protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srrm1Q52KI8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Srrm1Q52KI8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Srrm1Q52KI8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Srrm1Q52KI8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Srrm1Q52KI8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Srrm1Q52KI8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Srrm1Q52KI8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Srrm1Q52KI8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Srrm1Q52KI8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Srrm1Q52KI8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Srrm1Q52KI8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Srrm1Q52KI8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Srrm1Q52KI8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Srrm1Q52KI8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Srrm1Q52KI8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Srrm1Q52KI8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Srrm1Q52KI8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Srrm1Q52KI8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Srrm1Q52KI8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Srrm1Q52KI8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Srrm1Q52KI8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Srrm1Q52KI8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Srrm1Q52KI8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Srrm1Q52KI8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Srrm1Q52KI8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Srrm1Q52KI8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Srrm1Q52KI8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Srrm1Q52KI8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Srrm1Q52KI8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Srrm1Q52KI8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Srrm1Q52KI8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Srrm1Q52KI8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Srrm1Q52KI8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Srrm1Q52KI8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Srrm1Q52KI8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Srrm1Q52KI8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Srrm1Q52KI8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Srrm1Q52KI8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Srrm1Q52KI8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Srrm1Q52KI8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Srrm1Q52KI8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Srrm1Q52KI8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Srrm1Q52KI8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Srrm1Q52KI8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Srrm1Q52KI8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Srrm1Q52KI8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Srrm1Q52KI8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Srrm1Q52KI8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Srrm1Q52KI8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Srrm1Q52KI8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Srrm1Q52KI8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Srrm1Q52KI8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Srrm1Q52KI8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Srrm1Q52KI8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Srrm1Q52KI8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Srrm1Q52KI8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Srrm1Q52KI8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Srrm1Q52KI8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Srrm1Q52KI8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Srrm1Q52KI8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Srrm1Q52KI8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Srrm1Q52KI8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Srrm1Q52KI8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Srrm1Q52KI8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Srrm1Q52KI8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Srrm1Q52KI8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Srrm1Q52KI8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Srrm1Q52KI8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Srrm1Q52KI8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Srrm1Q52KI8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Srrm1Q52KI8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Srrm1Q52KI8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Srrm1Q52KI8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Srrm1Q52KI8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Srrm1Q52KI8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Srrm1Q52KI8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Srrm1Q52KI8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Srrm1Q52KI8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Srrm1Q52KI8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Srrm1Q52KI8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Srrm1Q52KI8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Srrm1Q52KI8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Srrm1Q52KI8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Srrm1Q52KI8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Srrm1Q52KI8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Srrm1Q52KI8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Srrm1Q52KI8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Srrm1Q52KI8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Srrm1Q52KI8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Srrm1Q52KI8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Srrm1Q52KI8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Srrm1Q52KI8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Srrm1Q52KI8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Srrm1Q52KI8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Srrm1Q52KI8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Srrm1Q52KI8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Srrm1Q52KI8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Srrm1Q52KI8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Srrm1Q52KI8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Srrm1Q52KI8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1740.8 ms