Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Shank3Q4ACU6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Shank3Q4ACU6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Shank3Q4ACU6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Shank3Q4ACU6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Shank3Q4ACU6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Shank3Q4ACU6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Shank3Q4ACU6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Shank3Q4ACU6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Shank3Q4ACU6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Shank3Q4ACU6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Shank3Q4ACU6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Shank3Q4ACU6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Shank3Q4ACU6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Shank3Q4ACU6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Shank3Q4ACU6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Shank3Q4ACU6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Shank3Q4ACU6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Shank3Q4ACU6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Shank3Q4ACU6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Shank3Q4ACU6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Shank3Q4ACU6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Shank3Q4ACU6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Shank3Q4ACU6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Shank3Q4ACU6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Shank3Q4ACU6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Shank3Q4ACU6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Shank3Q4ACU6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Shank3Q4ACU6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Shank3Q4ACU6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Shank3Q4ACU6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Shank3Q4ACU6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Shank3Q4ACU6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Shank3Q4ACU6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Shank3Q4ACU6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Shank3Q4ACU6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Shank3Q4ACU6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Shank3Q4ACU6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Shank3Q4ACU6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Shank3Q4ACU6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Shank3Q4ACU6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Shank3Q4ACU6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Shank3Q4ACU6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Shank3Q4ACU6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Shank3Q4ACU6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Shank3Q4ACU6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Shank3Q4ACU6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Shank3Q4ACU6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Shank3Q4ACU6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Shank3Q4ACU6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Shank3Q4ACU6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Shank3Q4ACU6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Shank3Q4ACU6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Shank3Q4ACU6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Shank3Q4ACU6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Shank3Q4ACU6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Shank3Q4ACU6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Shank3Q4ACU6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Shank3Q4ACU6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Shank3Q4ACU6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Shank3Q4ACU6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Shank3Q4ACU6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Shank3Q4ACU6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Shank3Q4ACU6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Shank3Q4ACU6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Shank3Q4ACU6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Shank3Q4ACU6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Shank3Q4ACU6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Shank3Q4ACU6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Shank3Q4ACU6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Shank3Q4ACU6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Shank3Q4ACU6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Shank3Q4ACU6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Shank3Q4ACU6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Shank3Q4ACU6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Shank3Q4ACU6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Shank3Q4ACU6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Shank3Q4ACU6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Shank3Q4ACU6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Shank3Q4ACU6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Shank3Q4ACU6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Shank3Q4ACU6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Shank3Q4ACU6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Shank3Q4ACU6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Shank3Q4ACU6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Shank3Q4ACU6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Shank3Q4ACU6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Shank3Q4ACU6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Shank3Q4ACU6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Shank3Q4ACU6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Shank3Q4ACU6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Shank3Q4ACU6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Shank3Q4ACU6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Shank3Q4ACU6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Shank3Q4ACU6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Shank3Q4ACU6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Shank3Q4ACU6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Shank3Q4ACU6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Shank3Q4ACU6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Shank3Q4ACU6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms