Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnpc3Q3UZ01 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnpc3Q3UZ01 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnpc3Q3UZ01 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnpc3Q3UZ01 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rnpc3Q3UZ01 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rnpc3Q3UZ01 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Rnpc3Q3UZ01 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rnpc3Q3UZ01 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rnpc3Q3UZ01 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rnpc3Q3UZ01 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rnpc3Q3UZ01 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rnpc3Q3UZ01 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rnpc3Q3UZ01 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rnpc3Q3UZ01 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rnpc3Q3UZ01 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rnpc3Q3UZ01 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rnpc3Q3UZ01 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rnpc3Q3UZ01 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rnpc3Q3UZ01 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rnpc3Q3UZ01 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rnpc3Q3UZ01 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rnpc3Q3UZ01 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rnpc3Q3UZ01 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rnpc3Q3UZ01 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rnpc3Q3UZ01 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Rnpc3Q3UZ01 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rnpc3Q3UZ01 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnpc3Q3UZ01 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnpc3Q3UZ01 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnpc3Q3UZ01 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnpc3Q3UZ01 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnpc3Q3UZ01 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnpc3Q3UZ01 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnpc3Q3UZ01 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnpc3Q3UZ01 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnpc3Q3UZ01 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnpc3Q3UZ01 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnpc3Q3UZ01 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnpc3Q3UZ01 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnpc3Q3UZ01 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnpc3Q3UZ01 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnpc3Q3UZ01 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnpc3Q3UZ01 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnpc3Q3UZ01 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rnpc3Q3UZ01 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rnpc3Q3UZ01 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rnpc3Q3UZ01 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rnpc3Q3UZ01 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnpc3Q3UZ01 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnpc3Q3UZ01 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnpc3Q3UZ01 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnpc3Q3UZ01 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnpc3Q3UZ01 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnpc3Q3UZ01 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnpc3Q3UZ01 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnpc3Q3UZ01 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnpc3Q3UZ01 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnpc3Q3UZ01 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnpc3Q3UZ01 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnpc3Q3UZ01 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnpc3Q3UZ01 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnpc3Q3UZ01 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnpc3Q3UZ01 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnpc3Q3UZ01 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnpc3Q3UZ01 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnpc3Q3UZ01 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnpc3Q3UZ01 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnpc3Q3UZ01 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnpc3Q3UZ01 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnpc3Q3UZ01 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnpc3Q3UZ01 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnpc3Q3UZ01 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnpc3Q3UZ01 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnpc3Q3UZ01 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnpc3Q3UZ01 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnpc3Q3UZ01 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnpc3Q3UZ01 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnpc3Q3UZ01 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnpc3Q3UZ01 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnpc3Q3UZ01 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnpc3Q3UZ01 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnpc3Q3UZ01 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnpc3Q3UZ01 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnpc3Q3UZ01 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnpc3Q3UZ01 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnpc3Q3UZ01 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnpc3Q3UZ01 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnpc3Q3UZ01 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnpc3Q3UZ01 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnpc3Q3UZ01 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnpc3Q3UZ01 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnpc3Q3UZ01 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnpc3Q3UZ01 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnpc3Q3UZ01 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnpc3Q3UZ01 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnpc3Q3UZ01 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnpc3Q3UZ01 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnpc3Q3UZ01 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnpc3Q3UZ01 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms