Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
E330034G19RikQ3UWX6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E330034G19RikQ3UWX6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E330034G19RikQ3UWX6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
E330034G19RikQ3UWX6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E330034G19RikQ3UWX6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E330034G19RikQ3UWX6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E330034G19RikQ3UWX6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E330034G19RikQ3UWX6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
E330034G19RikQ3UWX6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E330034G19RikQ3UWX6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E330034G19RikQ3UWX6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E330034G19RikQ3UWX6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E330034G19RikQ3UWX6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E330034G19RikQ3UWX6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E330034G19RikQ3UWX6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E330034G19RikQ3UWX6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E330034G19RikQ3UWX6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E330034G19RikQ3UWX6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E330034G19RikQ3UWX6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E330034G19RikQ3UWX6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E330034G19RikQ3UWX6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E330034G19RikQ3UWX6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
E330034G19RikQ3UWX6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E330034G19RikQ3UWX6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E330034G19RikQ3UWX6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E330034G19RikQ3UWX6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E330034G19RikQ3UWX6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E330034G19RikQ3UWX6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E330034G19RikQ3UWX6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E330034G19RikQ3UWX6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E330034G19RikQ3UWX6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E330034G19RikQ3UWX6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E330034G19RikQ3UWX6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E330034G19RikQ3UWX6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
E330034G19RikQ3UWX6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E330034G19RikQ3UWX6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E330034G19RikQ3UWX6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E330034G19RikQ3UWX6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E330034G19RikQ3UWX6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E330034G19RikQ3UWX6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E330034G19RikQ3UWX6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E330034G19RikQ3UWX6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
E330034G19RikQ3UWX6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
E330034G19RikQ3UWX6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
E330034G19RikQ3UWX6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E330034G19RikQ3UWX6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E330034G19RikQ3UWX6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E330034G19RikQ3UWX6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E330034G19RikQ3UWX6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E330034G19RikQ3UWX6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
E330034G19RikQ3UWX6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E330034G19RikQ3UWX6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.31■■□□□ 1
E330034G19RikQ3UWX6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E330034G19RikQ3UWX6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E330034G19RikQ3UWX6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.31■■□□□ 1
E330034G19RikQ3UWX6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
E330034G19RikQ3UWX6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E330034G19RikQ3UWX6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E330034G19RikQ3UWX6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
E330034G19RikQ3UWX6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E330034G19RikQ3UWX6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E330034G19RikQ3UWX6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E330034G19RikQ3UWX6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E330034G19RikQ3UWX6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E330034G19RikQ3UWX6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E330034G19RikQ3UWX6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E330034G19RikQ3UWX6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
E330034G19RikQ3UWX6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E330034G19RikQ3UWX6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E330034G19RikQ3UWX6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
E330034G19RikQ3UWX6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
E330034G19RikQ3UWX6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
E330034G19RikQ3UWX6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.29■■□□□ 1
E330034G19RikQ3UWX6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E330034G19RikQ3UWX6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E330034G19RikQ3UWX6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E330034G19RikQ3UWX6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E330034G19RikQ3UWX6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E330034G19RikQ3UWX6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E330034G19RikQ3UWX6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E330034G19RikQ3UWX6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E330034G19RikQ3UWX6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
E330034G19RikQ3UWX6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.27■■□□□ 1
E330034G19RikQ3UWX6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E330034G19RikQ3UWX6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E330034G19RikQ3UWX6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
E330034G19RikQ3UWX6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E330034G19RikQ3UWX6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
E330034G19RikQ3UWX6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E330034G19RikQ3UWX6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E330034G19RikQ3UWX6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E330034G19RikQ3UWX6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E330034G19RikQ3UWX6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms