Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTQ7

Prdm10, PR domain zinc finger protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm10Q3UTQ7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Prdm10Q3UTQ7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Prdm10Q3UTQ7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Prdm10Q3UTQ7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Prdm10Q3UTQ7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Prdm10Q3UTQ7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Prdm10Q3UTQ7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Prdm10Q3UTQ7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Prdm10Q3UTQ7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Prdm10Q3UTQ7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Prdm10Q3UTQ7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Prdm10Q3UTQ7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Prdm10Q3UTQ7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Prdm10Q3UTQ7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Prdm10Q3UTQ7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Prdm10Q3UTQ7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Prdm10Q3UTQ7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Prdm10Q3UTQ7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Prdm10Q3UTQ7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Prdm10Q3UTQ7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Prdm10Q3UTQ7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Prdm10Q3UTQ7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Prdm10Q3UTQ7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Prdm10Q3UTQ7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Prdm10Q3UTQ7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Prdm10Q3UTQ7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Prdm10Q3UTQ7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Prdm10Q3UTQ7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Prdm10Q3UTQ7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Prdm10Q3UTQ7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Prdm10Q3UTQ7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Prdm10Q3UTQ7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Prdm10Q3UTQ7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Prdm10Q3UTQ7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Prdm10Q3UTQ7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Prdm10Q3UTQ7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Prdm10Q3UTQ7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Prdm10Q3UTQ7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Prdm10Q3UTQ7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Prdm10Q3UTQ7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Prdm10Q3UTQ7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Prdm10Q3UTQ7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Prdm10Q3UTQ7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Prdm10Q3UTQ7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Prdm10Q3UTQ7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Prdm10Q3UTQ7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Prdm10Q3UTQ7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Prdm10Q3UTQ7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Prdm10Q3UTQ7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Prdm10Q3UTQ7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Prdm10Q3UTQ7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Prdm10Q3UTQ7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Prdm10Q3UTQ7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Prdm10Q3UTQ7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Prdm10Q3UTQ7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Prdm10Q3UTQ7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Prdm10Q3UTQ7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Prdm10Q3UTQ7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Prdm10Q3UTQ7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Prdm10Q3UTQ7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Prdm10Q3UTQ7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Prdm10Q3UTQ7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Prdm10Q3UTQ7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Prdm10Q3UTQ7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Prdm10Q3UTQ7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Prdm10Q3UTQ7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Prdm10Q3UTQ7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Prdm10Q3UTQ7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Prdm10Q3UTQ7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Prdm10Q3UTQ7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Prdm10Q3UTQ7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Prdm10Q3UTQ7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Prdm10Q3UTQ7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Prdm10Q3UTQ7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Prdm10Q3UTQ7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Prdm10Q3UTQ7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Prdm10Q3UTQ7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Prdm10Q3UTQ7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Prdm10Q3UTQ7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Prdm10Q3UTQ7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Prdm10Q3UTQ7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Prdm10Q3UTQ7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Prdm10Q3UTQ7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Prdm10Q3UTQ7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Prdm10Q3UTQ7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Prdm10Q3UTQ7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Prdm10Q3UTQ7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Prdm10Q3UTQ7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Prdm10Q3UTQ7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Prdm10Q3UTQ7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Prdm10Q3UTQ7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Prdm10Q3UTQ7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Prdm10Q3UTQ7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Prdm10Q3UTQ7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Prdm10Q3UTQ7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Prdm10Q3UTQ7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Prdm10Q3UTQ7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Prdm10Q3UTQ7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Prdm10Q3UTQ7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Prdm10Q3UTQ7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms