Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1N2

Srebf2, Sterol regulatory element-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srebf2Q3U1N2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Srebf2Q3U1N2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Srebf2Q3U1N2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Srebf2Q3U1N2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Srebf2Q3U1N2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Srebf2Q3U1N2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Srebf2Q3U1N2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srebf2Q3U1N2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srebf2Q3U1N2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srebf2Q3U1N2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srebf2Q3U1N2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srebf2Q3U1N2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srebf2Q3U1N2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srebf2Q3U1N2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Srebf2Q3U1N2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Srebf2Q3U1N2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Srebf2Q3U1N2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Srebf2Q3U1N2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Srebf2Q3U1N2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Srebf2Q3U1N2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Srebf2Q3U1N2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Srebf2Q3U1N2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Srebf2Q3U1N2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Srebf2Q3U1N2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Srebf2Q3U1N2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Srebf2Q3U1N2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Srebf2Q3U1N2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srebf2Q3U1N2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srebf2Q3U1N2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srebf2Q3U1N2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Srebf2Q3U1N2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srebf2Q3U1N2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Srebf2Q3U1N2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srebf2Q3U1N2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srebf2Q3U1N2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srebf2Q3U1N2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srebf2Q3U1N2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srebf2Q3U1N2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srebf2Q3U1N2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srebf2Q3U1N2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srebf2Q3U1N2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srebf2Q3U1N2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srebf2Q3U1N2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srebf2Q3U1N2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srebf2Q3U1N2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srebf2Q3U1N2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srebf2Q3U1N2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srebf2Q3U1N2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srebf2Q3U1N2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srebf2Q3U1N2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srebf2Q3U1N2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srebf2Q3U1N2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srebf2Q3U1N2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Srebf2Q3U1N2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Srebf2Q3U1N2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Srebf2Q3U1N2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Srebf2Q3U1N2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Srebf2Q3U1N2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Srebf2Q3U1N2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srebf2Q3U1N2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srebf2Q3U1N2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srebf2Q3U1N2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srebf2Q3U1N2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srebf2Q3U1N2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Srebf2Q3U1N2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srebf2Q3U1N2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srebf2Q3U1N2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Srebf2Q3U1N2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Srebf2Q3U1N2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Srebf2Q3U1N2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Srebf2Q3U1N2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Srebf2Q3U1N2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Srebf2Q3U1N2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Srebf2Q3U1N2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Srebf2Q3U1N2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Srebf2Q3U1N2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Srebf2Q3U1N2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Srebf2Q3U1N2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Srebf2Q3U1N2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Srebf2Q3U1N2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srebf2Q3U1N2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srebf2Q3U1N2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srebf2Q3U1N2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srebf2Q3U1N2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srebf2Q3U1N2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srebf2Q3U1N2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srebf2Q3U1N2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srebf2Q3U1N2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srebf2Q3U1N2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srebf2Q3U1N2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srebf2Q3U1N2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srebf2Q3U1N2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srebf2Q3U1N2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srebf2Q3U1N2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Srebf2Q3U1N2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Srebf2Q3U1N2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Srebf2Q3U1N2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Srebf2Q3U1N2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Srebf2Q3U1N2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Srebf2Q3U1N2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 182.5 ms