Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYP4

Tmem88b, Transmembrane protein 88B, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88bQ3TYP4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem88bQ3TYP4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem88bQ3TYP4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem88bQ3TYP4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem88bQ3TYP4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem88bQ3TYP4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem88bQ3TYP4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem88bQ3TYP4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem88bQ3TYP4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem88bQ3TYP4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem88bQ3TYP4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem88bQ3TYP4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem88bQ3TYP4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem88bQ3TYP4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem88bQ3TYP4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem88bQ3TYP4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem88bQ3TYP4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem88bQ3TYP4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem88bQ3TYP4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmem88bQ3TYP4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem88bQ3TYP4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem88bQ3TYP4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem88bQ3TYP4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem88bQ3TYP4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem88bQ3TYP4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem88bQ3TYP4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem88bQ3TYP4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem88bQ3TYP4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem88bQ3TYP4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem88bQ3TYP4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem88bQ3TYP4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem88bQ3TYP4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem88bQ3TYP4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem88bQ3TYP4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem88bQ3TYP4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem88bQ3TYP4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem88bQ3TYP4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem88bQ3TYP4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem88bQ3TYP4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem88bQ3TYP4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem88bQ3TYP4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem88bQ3TYP4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem88bQ3TYP4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem88bQ3TYP4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem88bQ3TYP4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem88bQ3TYP4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem88bQ3TYP4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem88bQ3TYP4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem88bQ3TYP4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem88bQ3TYP4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem88bQ3TYP4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem88bQ3TYP4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem88bQ3TYP4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem88bQ3TYP4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem88bQ3TYP4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem88bQ3TYP4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem88bQ3TYP4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem88bQ3TYP4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem88bQ3TYP4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem88bQ3TYP4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem88bQ3TYP4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem88bQ3TYP4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem88bQ3TYP4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem88bQ3TYP4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem88bQ3TYP4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem88bQ3TYP4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem88bQ3TYP4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem88bQ3TYP4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem88bQ3TYP4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem88bQ3TYP4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem88bQ3TYP4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem88bQ3TYP4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem88bQ3TYP4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem88bQ3TYP4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem88bQ3TYP4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmem88bQ3TYP4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmem88bQ3TYP4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem88bQ3TYP4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem88bQ3TYP4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem88bQ3TYP4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem88bQ3TYP4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem88bQ3TYP4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem88bQ3TYP4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem88bQ3TYP4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem88bQ3TYP4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem88bQ3TYP4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem88bQ3TYP4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem88bQ3TYP4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem88bQ3TYP4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem88bQ3TYP4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem88bQ3TYP4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem88bQ3TYP4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem88bQ3TYP4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem88bQ3TYP4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem88bQ3TYP4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem88bQ3TYP4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem88bQ3TYP4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem88bQ3TYP4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem88bQ3TYP4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem88bQ3TYP4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms