Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CiartQ3TQ03 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CiartQ3TQ03 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CiartQ3TQ03 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CiartQ3TQ03 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CiartQ3TQ03 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CiartQ3TQ03 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CiartQ3TQ03 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CiartQ3TQ03 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CiartQ3TQ03 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CiartQ3TQ03 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CiartQ3TQ03 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CiartQ3TQ03 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CiartQ3TQ03 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CiartQ3TQ03 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CiartQ3TQ03 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CiartQ3TQ03 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CiartQ3TQ03 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CiartQ3TQ03 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CiartQ3TQ03 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CiartQ3TQ03 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CiartQ3TQ03 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CiartQ3TQ03 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CiartQ3TQ03 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CiartQ3TQ03 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CiartQ3TQ03 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CiartQ3TQ03 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CiartQ3TQ03 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CiartQ3TQ03 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CiartQ3TQ03 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CiartQ3TQ03 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CiartQ3TQ03 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CiartQ3TQ03 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CiartQ3TQ03 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CiartQ3TQ03 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CiartQ3TQ03 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CiartQ3TQ03 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CiartQ3TQ03 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CiartQ3TQ03 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CiartQ3TQ03 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CiartQ3TQ03 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CiartQ3TQ03 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CiartQ3TQ03 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CiartQ3TQ03 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CiartQ3TQ03 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CiartQ3TQ03 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CiartQ3TQ03 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CiartQ3TQ03 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CiartQ3TQ03 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CiartQ3TQ03 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CiartQ3TQ03 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CiartQ3TQ03 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CiartQ3TQ03 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CiartQ3TQ03 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CiartQ3TQ03 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CiartQ3TQ03 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CiartQ3TQ03 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CiartQ3TQ03 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CiartQ3TQ03 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CiartQ3TQ03 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CiartQ3TQ03 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CiartQ3TQ03 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CiartQ3TQ03 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CiartQ3TQ03 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CiartQ3TQ03 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CiartQ3TQ03 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CiartQ3TQ03 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CiartQ3TQ03 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CiartQ3TQ03 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CiartQ3TQ03 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CiartQ3TQ03 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CiartQ3TQ03 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CiartQ3TQ03 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CiartQ3TQ03 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CiartQ3TQ03 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CiartQ3TQ03 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CiartQ3TQ03 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CiartQ3TQ03 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CiartQ3TQ03 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CiartQ3TQ03 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CiartQ3TQ03 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CiartQ3TQ03 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CiartQ3TQ03 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CiartQ3TQ03 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CiartQ3TQ03 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CiartQ3TQ03 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CiartQ3TQ03 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CiartQ3TQ03 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CiartQ3TQ03 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CiartQ3TQ03 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CiartQ3TQ03 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CiartQ3TQ03 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CiartQ3TQ03 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CiartQ3TQ03 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CiartQ3TQ03 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CiartQ3TQ03 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CiartQ3TQ03 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CiartQ3TQ03 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CiartQ3TQ03 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CiartQ3TQ03 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms