Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdlim7Q3TJD7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdlim7Q3TJD7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdlim7Q3TJD7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdlim7Q3TJD7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pdlim7Q3TJD7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pdlim7Q3TJD7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pdlim7Q3TJD7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdlim7Q3TJD7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdlim7Q3TJD7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdlim7Q3TJD7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdlim7Q3TJD7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdlim7Q3TJD7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdlim7Q3TJD7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdlim7Q3TJD7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdlim7Q3TJD7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdlim7Q3TJD7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdlim7Q3TJD7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdlim7Q3TJD7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdlim7Q3TJD7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdlim7Q3TJD7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdlim7Q3TJD7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdlim7Q3TJD7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdlim7Q3TJD7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdlim7Q3TJD7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdlim7Q3TJD7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdlim7Q3TJD7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdlim7Q3TJD7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdlim7Q3TJD7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdlim7Q3TJD7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdlim7Q3TJD7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdlim7Q3TJD7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdlim7Q3TJD7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdlim7Q3TJD7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdlim7Q3TJD7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdlim7Q3TJD7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdlim7Q3TJD7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdlim7Q3TJD7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdlim7Q3TJD7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdlim7Q3TJD7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdlim7Q3TJD7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdlim7Q3TJD7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdlim7Q3TJD7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdlim7Q3TJD7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdlim7Q3TJD7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdlim7Q3TJD7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pdlim7Q3TJD7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pdlim7Q3TJD7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pdlim7Q3TJD7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Pdlim7Q3TJD7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pdlim7Q3TJD7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pdlim7Q3TJD7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdlim7Q3TJD7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdlim7Q3TJD7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdlim7Q3TJD7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdlim7Q3TJD7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdlim7Q3TJD7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdlim7Q3TJD7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdlim7Q3TJD7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdlim7Q3TJD7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdlim7Q3TJD7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdlim7Q3TJD7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdlim7Q3TJD7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdlim7Q3TJD7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdlim7Q3TJD7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdlim7Q3TJD7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdlim7Q3TJD7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdlim7Q3TJD7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdlim7Q3TJD7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdlim7Q3TJD7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdlim7Q3TJD7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdlim7Q3TJD7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdlim7Q3TJD7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdlim7Q3TJD7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdlim7Q3TJD7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdlim7Q3TJD7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdlim7Q3TJD7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdlim7Q3TJD7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdlim7Q3TJD7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdlim7Q3TJD7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdlim7Q3TJD7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdlim7Q3TJD7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdlim7Q3TJD7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdlim7Q3TJD7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdlim7Q3TJD7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdlim7Q3TJD7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdlim7Q3TJD7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdlim7Q3TJD7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdlim7Q3TJD7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdlim7Q3TJD7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdlim7Q3TJD7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdlim7Q3TJD7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdlim7Q3TJD7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdlim7Q3TJD7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdlim7Q3TJD7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdlim7Q3TJD7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdlim7Q3TJD7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdlim7Q3TJD7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdlim7Q3TJD7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdlim7Q3TJD7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms