Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc13Q3TIR1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc13Q3TIR1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc13Q3TIR1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc13Q3TIR1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc13Q3TIR1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc13Q3TIR1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc13Q3TIR1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc13Q3TIR1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc13Q3TIR1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc13Q3TIR1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc13Q3TIR1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc13Q3TIR1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc13Q3TIR1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc13Q3TIR1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc13Q3TIR1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc13Q3TIR1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc13Q3TIR1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc13Q3TIR1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc13Q3TIR1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc13Q3TIR1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc13Q3TIR1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc13Q3TIR1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc13Q3TIR1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc13Q3TIR1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc13Q3TIR1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc13Q3TIR1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc13Q3TIR1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc13Q3TIR1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc13Q3TIR1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc13Q3TIR1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc13Q3TIR1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc13Q3TIR1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc13Q3TIR1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc13Q3TIR1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc13Q3TIR1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc13Q3TIR1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc13Q3TIR1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc13Q3TIR1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc13Q3TIR1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Trappc13Q3TIR1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Trappc13Q3TIR1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Trappc13Q3TIR1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Trappc13Q3TIR1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Trappc13Q3TIR1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Trappc13Q3TIR1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trappc13Q3TIR1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trappc13Q3TIR1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trappc13Q3TIR1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trappc13Q3TIR1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trappc13Q3TIR1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trappc13Q3TIR1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trappc13Q3TIR1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trappc13Q3TIR1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc13Q3TIR1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc13Q3TIR1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc13Q3TIR1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc13Q3TIR1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc13Q3TIR1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc13Q3TIR1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc13Q3TIR1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc13Q3TIR1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc13Q3TIR1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc13Q3TIR1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc13Q3TIR1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc13Q3TIR1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc13Q3TIR1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc13Q3TIR1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc13Q3TIR1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc13Q3TIR1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc13Q3TIR1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc13Q3TIR1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc13Q3TIR1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc13Q3TIR1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc13Q3TIR1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc13Q3TIR1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc13Q3TIR1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc13Q3TIR1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc13Q3TIR1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc13Q3TIR1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc13Q3TIR1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc13Q3TIR1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc13Q3TIR1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc13Q3TIR1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc13Q3TIR1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc13Q3TIR1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc13Q3TIR1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc13Q3TIR1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc13Q3TIR1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc13Q3TIR1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc13Q3TIR1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc13Q3TIR1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc13Q3TIR1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trappc13Q3TIR1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trappc13Q3TIR1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trappc13Q3TIR1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms