Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MICAQ29983 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MICAQ29983 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MICAQ29983 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MICAQ29983 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MICAQ29983 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MICAQ29983 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MICAQ29983 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MICAQ29983 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MICAQ29983 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MICAQ29983 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MICAQ29983 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MICAQ29983 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MICAQ29983 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MICAQ29983 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MICAQ29983 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MICAQ29983 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MICAQ29983 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MICAQ29983 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MICAQ29983 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MICAQ29983 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MICAQ29983 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MICAQ29983 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MICAQ29983 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MICAQ29983 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MICAQ29983 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MICAQ29983 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MICAQ29983 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MICAQ29983 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MICAQ29983 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MICAQ29983 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MICAQ29983 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MICAQ29983 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MICAQ29983 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MICAQ29983 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MICAQ29983 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MICAQ29983 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MICAQ29983 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MICAQ29983 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MICAQ29983 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MICAQ29983 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MICAQ29983 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MICAQ29983 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MICAQ29983 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MICAQ29983 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MICAQ29983 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MICAQ29983 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MICAQ29983 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MICAQ29983 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MICAQ29983 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MICAQ29983 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MICAQ29983 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MICAQ29983 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MICAQ29983 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MICAQ29983 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MICAQ29983 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MICAQ29983 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MICAQ29983 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MICAQ29983 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MICAQ29983 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MICAQ29983 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MICAQ29983 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MICAQ29983 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MICAQ29983 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MICAQ29983 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MICAQ29983 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MICAQ29983 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MICAQ29983 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MICAQ29983 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MICAQ29983 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MICAQ29983 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MICAQ29983 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MICAQ29983 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MICAQ29983 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MICAQ29983 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MICAQ29983 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MICAQ29983 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MICAQ29983 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MICAQ29983 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MICAQ29983 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MICAQ29983 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MICAQ29983 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MICAQ29983 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MICAQ29983 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MICAQ29983 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MICAQ29983 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MICAQ29983 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MICAQ29983 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MICAQ29983 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MICAQ29983 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MICAQ29983 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MICAQ29983 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MICAQ29983 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MICAQ29983 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MICAQ29983 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MICAQ29983 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MICAQ29983 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MICAQ29983 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MICAQ29983 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MICAQ29983 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms