Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NTRK2Q16620 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NTRK2Q16620 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NTRK2Q16620 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NTRK2Q16620 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NTRK2Q16620 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NTRK2Q16620 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NTRK2Q16620 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NTRK2Q16620 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NTRK2Q16620 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NTRK2Q16620 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NTRK2Q16620 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NTRK2Q16620 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NTRK2Q16620 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NTRK2Q16620 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NTRK2Q16620 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NTRK2Q16620 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NTRK2Q16620 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NTRK2Q16620 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NTRK2Q16620 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NTRK2Q16620 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NTRK2Q16620 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NTRK2Q16620 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NTRK2Q16620 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NTRK2Q16620 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NTRK2Q16620 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NTRK2Q16620 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NTRK2Q16620 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NTRK2Q16620 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NTRK2Q16620 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NTRK2Q16620 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NTRK2Q16620 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NTRK2Q16620 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NTRK2Q16620 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NTRK2Q16620 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NTRK2Q16620 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NTRK2Q16620 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NTRK2Q16620 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NTRK2Q16620 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NTRK2Q16620 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NTRK2Q16620 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NTRK2Q16620 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NTRK2Q16620 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NTRK2Q16620 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NTRK2Q16620 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NTRK2Q16620 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NTRK2Q16620 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NTRK2Q16620 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NTRK2Q16620 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NTRK2Q16620 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NTRK2Q16620 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NTRK2Q16620 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NTRK2Q16620 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NTRK2Q16620 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NTRK2Q16620 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NTRK2Q16620 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NTRK2Q16620 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NTRK2Q16620 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NTRK2Q16620 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NTRK2Q16620 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NTRK2Q16620 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NTRK2Q16620 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NTRK2Q16620 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NTRK2Q16620 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NTRK2Q16620 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NTRK2Q16620 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NTRK2Q16620 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NTRK2Q16620 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NTRK2Q16620 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NTRK2Q16620 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NTRK2Q16620 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NTRK2Q16620 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NTRK2Q16620 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NTRK2Q16620 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NTRK2Q16620 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NTRK2Q16620 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NTRK2Q16620 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NTRK2Q16620 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NTRK2Q16620 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NTRK2Q16620 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NTRK2Q16620 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NTRK2Q16620 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NTRK2Q16620 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NTRK2Q16620 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NTRK2Q16620 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NTRK2Q16620 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NTRK2Q16620 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NTRK2Q16620 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NTRK2Q16620 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NTRK2Q16620 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NTRK2Q16620 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NTRK2Q16620 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NTRK2Q16620 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NTRK2Q16620 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NTRK2Q16620 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NTRK2Q16620 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NTRK2Q16620 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NTRK2Q16620 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NTRK2Q16620 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NTRK2Q16620 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms