Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC18A3Q16572 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC18A3Q16572 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC18A3Q16572 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC18A3Q16572 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC18A3Q16572 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC18A3Q16572 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC18A3Q16572 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC18A3Q16572 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC18A3Q16572 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC18A3Q16572 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC18A3Q16572 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC18A3Q16572 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC18A3Q16572 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC18A3Q16572 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC18A3Q16572 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC18A3Q16572 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC18A3Q16572 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC18A3Q16572 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC18A3Q16572 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC18A3Q16572 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC18A3Q16572 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC18A3Q16572 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC18A3Q16572 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC18A3Q16572 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC18A3Q16572 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC18A3Q16572 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC18A3Q16572 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC18A3Q16572 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC18A3Q16572 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC18A3Q16572 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC18A3Q16572 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC18A3Q16572 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC18A3Q16572 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC18A3Q16572 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC18A3Q16572 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC18A3Q16572 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC18A3Q16572 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC18A3Q16572 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC18A3Q16572 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC18A3Q16572 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC18A3Q16572 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC18A3Q16572 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC18A3Q16572 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC18A3Q16572 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC18A3Q16572 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC18A3Q16572 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC18A3Q16572 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC18A3Q16572 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC18A3Q16572 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC18A3Q16572 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC18A3Q16572 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC18A3Q16572 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC18A3Q16572 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC18A3Q16572 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC18A3Q16572 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC18A3Q16572 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC18A3Q16572 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC18A3Q16572 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC18A3Q16572 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC18A3Q16572 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC18A3Q16572 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC18A3Q16572 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC18A3Q16572 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC18A3Q16572 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC18A3Q16572 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC18A3Q16572 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC18A3Q16572 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC18A3Q16572 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC18A3Q16572 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC18A3Q16572 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC18A3Q16572 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC18A3Q16572 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC18A3Q16572 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC18A3Q16572 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC18A3Q16572 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC18A3Q16572 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC18A3Q16572 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC18A3Q16572 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC18A3Q16572 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC18A3Q16572 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC18A3Q16572 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC18A3Q16572 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC18A3Q16572 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC18A3Q16572 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC18A3Q16572 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC18A3Q16572 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC18A3Q16572 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC18A3Q16572 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC18A3Q16572 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC18A3Q16572 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC18A3Q16572 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC18A3Q16572 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC18A3Q16572 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC18A3Q16572 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC18A3Q16572 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC18A3Q16572 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC18A3Q16572 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC18A3Q16572 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC18A3Q16572 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
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