Protein–RNA interactions for Protein: Q15653

NFKBIB, NF-kappa-B inhibitor beta, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIBQ15653 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NFKBIBQ15653 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NFKBIBQ15653 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NFKBIBQ15653 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NFKBIBQ15653 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NFKBIBQ15653 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NFKBIBQ15653 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NFKBIBQ15653 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NFKBIBQ15653 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NFKBIBQ15653 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NFKBIBQ15653 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
NFKBIBQ15653 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NFKBIBQ15653 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NFKBIBQ15653 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NFKBIBQ15653 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NFKBIBQ15653 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NFKBIBQ15653 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NFKBIBQ15653 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NFKBIBQ15653 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NFKBIBQ15653 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NFKBIBQ15653 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NFKBIBQ15653 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NFKBIBQ15653 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NFKBIBQ15653 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NFKBIBQ15653 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NFKBIBQ15653 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NFKBIBQ15653 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NFKBIBQ15653 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NFKBIBQ15653 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NFKBIBQ15653 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NFKBIBQ15653 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NFKBIBQ15653 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NFKBIBQ15653 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NFKBIBQ15653 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NFKBIBQ15653 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NFKBIBQ15653 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NFKBIBQ15653 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NFKBIBQ15653 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NFKBIBQ15653 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NFKBIBQ15653 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NFKBIBQ15653 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NFKBIBQ15653 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NFKBIBQ15653 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NFKBIBQ15653 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NFKBIBQ15653 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NFKBIBQ15653 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NFKBIBQ15653 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NFKBIBQ15653 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NFKBIBQ15653 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NFKBIBQ15653 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NFKBIBQ15653 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NFKBIBQ15653 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NFKBIBQ15653 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NFKBIBQ15653 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NFKBIBQ15653 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NFKBIBQ15653 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NFKBIBQ15653 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NFKBIBQ15653 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NFKBIBQ15653 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NFKBIBQ15653 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NFKBIBQ15653 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NFKBIBQ15653 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NFKBIBQ15653 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NFKBIBQ15653 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NFKBIBQ15653 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NFKBIBQ15653 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NFKBIBQ15653 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NFKBIBQ15653 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NFKBIBQ15653 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NFKBIBQ15653 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NFKBIBQ15653 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NFKBIBQ15653 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NFKBIBQ15653 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NFKBIBQ15653 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NFKBIBQ15653 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NFKBIBQ15653 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NFKBIBQ15653 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NFKBIBQ15653 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NFKBIBQ15653 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NFKBIBQ15653 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NFKBIBQ15653 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NFKBIBQ15653 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NFKBIBQ15653 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NFKBIBQ15653 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NFKBIBQ15653 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NFKBIBQ15653 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NFKBIBQ15653 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NFKBIBQ15653 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NFKBIBQ15653 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NFKBIBQ15653 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NFKBIBQ15653 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NFKBIBQ15653 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NFKBIBQ15653 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NFKBIBQ15653 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NFKBIBQ15653 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NFKBIBQ15653 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NFKBIBQ15653 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NFKBIBQ15653 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NFKBIBQ15653 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NFKBIBQ15653 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms