Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 ZNF581-202ENST00000585995 591 ntTSL 321.15■□□□□ 0.981e-12■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 YPEL3-206ENST00000565479 865 ntTSL 521.09■□□□□ 0.976e-7■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.96e-7■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 YPEL3-210ENST00000568674 371 ntTSL 220.67■□□□□ 0.96e-7■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.886e-7■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 CCDC106-208ENST00000592996 741 ntTSL 320.45■□□□□ 0.861e-12■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.836e-7■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.826e-7■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 LUC7L2-203ENST00000435096 570 ntTSL 320.1■□□□□ 0.816e-7■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.816e-7■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 LUC7L2-204ENST00000456182 2411 ntTSL 1 (best)19.4■□□□□ 0.76e-7■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.76e-7■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 KDM5A-210ENST00000544760 2338 ntTSL 219.3■□□□□ 0.686e-7■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.656e-7■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 DIP2B-204ENST00000549620 2676 ntTSL 1 (best)18.94■□□□□ 0.626e-7■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.596e-7■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 PACS1-208ENST00000529677 679 ntTSL 318.47■□□□□ 0.552e-7■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.541e-12■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.536e-7■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.516e-7■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.496e-7■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 TMC6-222ENST00000592076 693 ntTSL 318.05■□□□□ 0.486e-7■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 YPEL3-211ENST00000568681 1739 ntTSL 217.42■□□□□ 0.386e-7■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.316e-7■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 LUC7L2-209ENST00000608368 551 ntTSL 416.09■□□□□ 0.176e-7■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.146e-7■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.073e-7■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.054e-7■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.021e-12■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 CMBL-207ENST00000514202 593 ntTSL 214.27□□□□□ -0.134e-37■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.226e-7■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 CMBL-204ENST00000506821 901 ntTSL 213.54□□□□□ -0.243e-14■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 NCOA4-203ENST00000580070 1755 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.36e-7■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 ZFP36L1-202ENST00000439696 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.534e-7■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 ZFP36L1-204ENST00000555997 3094 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.634e-7■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 NCOA4-202ENST00000579039 2211 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.666e-7■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 C7orf55-LUC7L2-201ENST00000541515 1661 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.796e-7■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 MAP4K4-220ENST00000627726 3135 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.796e-7■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 TNS1-202ENST00000310858 1792 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.856e-7■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 MAP4K4-213ENST00000476609 3598 ntTSL 29.19□□□□□ -0.946e-7■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 NCOA4-201ENST00000578454 2307 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.946e-7■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 MAP4K4-206ENST00000413150 6958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.056e-7■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 MAP4K4-212ENST00000456652 3855 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.076e-7■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 KDM5A-201ENST00000399788 10763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.086e-7■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 MAP4K4-201ENST00000302217 6624 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.16e-7■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 MAP4K4-219ENST00000625522 7458 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.16e-7■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 DIP2B-201ENST00000301180 8593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.116e-7■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 NCOA4-206ENST00000585056 2124 ntTSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.116e-7■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 MAP4K4-203ENST00000347699 3792 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.156e-7■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 NCOA4-204ENST00000581486 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.186e-7■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 GPX2-204ENST00000557323 778 ntTSL 37.28□□□□□ -1.246e-7■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.286e-7■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 GPX2-203ENST00000557049 476 ntTSL 36.26□□□□□ -1.416e-7■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 MAP4K4-207ENST00000417294 4251 ntTSL 56.13□□□□□ -1.436e-7■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.256e-7■■■■■ 35.6
PCBP1Q15365 FADS1-217ENST00000544309 581 ntTSL 320.34■□□□□ 0.856e-6■■■■■ 35.6
PCBP1Q15365 FADS1-202ENST00000421879 583 ntTSL 318.29■□□□□ 0.526e-6■■■■■ 35.6
PCBP1Q15365 RAD54L-204ENST00000463715 718 ntTSL 518.02■□□□□ 0.481e-6■■■■■ 35.6
PCBP1Q15365 RAD54L-212ENST00000493985 810 ntTSL 417.37■□□□□ 0.371e-6■■■■■ 35.6
PCBP1Q15365 FADS1-209ENST00000491310 525 ntTSL 515.36■□□□□ 0.056e-6■■■■■ 35.6
PCBP1Q15365 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.016e-6■■■■■ 35.6
PCBP1Q15365 FADS1-203ENST00000424501 926 ntTSL 314.83□□□□□ -0.046e-6■■■■■ 35.6
PCBP1Q15365 FADS1-205ENST00000448607 559 ntTSL 413.34□□□□□ -0.276e-6■■■■■ 35.6
PCBP1Q15365 RAD54L-205ENST00000469835 648 ntTSL 311.08□□□□□ -0.641e-6■■■■■ 35.6
PCBP1Q15365 RAD54L-202ENST00000442598 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.71e-6■■■■■ 35.6
PCBP1Q15365 RAD54L-201ENST00000371975 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.891e-6■■■■■ 35.6
PCBP1Q15365 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.112e-7■■■■■ 35.5
PCBP1Q15365 FNDC3B-206ENST00000443501 678 ntTSL 38.89□□□□□ -0.992e-7■■■■■ 35.4
PCBP1Q15365 FNDC3B-209ENST00000478016 554 ntTSL 43.83□□□□□ -1.82e-7■■■■■ 35.4
PCBP1Q15365 DCTN1-225ENST00000497666 479 ntTSL 317.99■□□□□ 0.471e-8■■■■■ 35.3
PCBP1Q15365 DCTN1-221ENST00000491465 2444 ntTSL 1 (best)15.03■□□□□ -01e-8■■■■■ 35.3
PCBP1Q15365 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.041e-8■■■■■ 35.3
PCBP1Q15365 DCTN1-218ENST00000466110 5414 ntTSL 213.32□□□□□ -0.281e-8■■■■■ 35.3
PCBP1Q15365 DCTN1-210ENST00000434055 4229 ntTSL 212.92□□□□□ -0.341e-8■■■■■ 35.3
PCBP1Q15365 DCTN1-206ENST00000409868 4202 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.431e-8■■■■■ 35.3
PCBP1Q15365 DCTN1-227ENST00000633691 4160 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.561e-8■■■■■ 35.3
PCBP1Q15365 DCTN1-201ENST00000361874 4500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.561e-8■■■■■ 35.3
PCBP1Q15365 DCTN1-202ENST00000394003 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.611e-8■■■■■ 35.3
PCBP1Q15365 DCTN1-204ENST00000409438 4145 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.71e-8■■■■■ 35.3
PCBP1Q15365 AC006030.1-201ENST00000451608 5059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71e-8■■■■■ 35.3
PCBP1Q15365 DCTN1-226ENST00000628224 4485 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.891e-8■■■■■ 35.3
PCBP1Q15365 TAL1-203ENST00000459729 1796 ntTSL 1 (best)25.86■■□□□ 1.732e-9■■■■■ 35.3
PCBP1Q15365 AC068580.4-202ENST00000636579 350 ntTSL 316.97■□□□□ 0.312e-14■■■■■ 35.3
PCBP1Q15365 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.62e-7■■■■■ 35.3
PCBP1Q15365 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.092e-7■■■■■ 35.3
PCBP1Q15365 WDTC1-205ENST00000491239 5149 ntTSL 213.88□□□□□ -0.192e-7■■■■■ 35.3
PCBP1Q15365 WDTC1-203ENST00000447062 3115 ntTSL 212.23□□□□□ -0.452e-7■■■■■ 35.3
PCBP1Q15365 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.363e-15■■■■■ 35.3
PCBP1Q15365 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.469e-7■■■■■ 35.3
PCBP1Q15365 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.059e-7■■■■■ 35.3
PCBP1Q15365 ARHGDIA-210ENST00000582520 245 ntTSL 310.36□□□□□ -0.755e-9■■■■■ 35.2
PCBP1Q15365 SLC35F2-202ENST00000524991 562 ntTSL 423.9■■□□□ 1.425e-6■■■■■ 35.1
PCBP1Q15365 SLC35F2-205ENST00000532513 1028 ntTSL 520.6■□□□□ 0.895e-6■■■■■ 35.1
PCBP1Q15365 SLC35F2-206ENST00000533664 1007 ntTSL 218.36■□□□□ 0.535e-6■■■■■ 35.1
PCBP1Q15365 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.135e-6■■■■■ 35.1
PCBP1Q15365 SLC35F2-201ENST00000375682 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.145e-6■■■■■ 35.1
PCBP1Q15365 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.155e-6■■■■■ 35.1
PCBP1Q15365 U2AF2-208ENST00000592874 849 ntTSL 518.48■□□□□ 0.558e-7■■■■■ 35
PCBP1Q15365 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.591e-9■■■■■ 34.9
PCBP1Q15365 STRN4-222ENST00000601869 2240 nt19.23■□□□□ 0.674e-7■■■■■ 34.9
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