Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NKX1-1Q15270 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NKX1-1Q15270 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NKX1-1Q15270 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NKX1-1Q15270 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NKX1-1Q15270 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NKX1-1Q15270 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
NKX1-1Q15270 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NKX1-1Q15270 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NKX1-1Q15270 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NKX1-1Q15270 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NKX1-1Q15270 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NKX1-1Q15270 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NKX1-1Q15270 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NKX1-1Q15270 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NKX1-1Q15270 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NKX1-1Q15270 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NKX1-1Q15270 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NKX1-1Q15270 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NKX1-1Q15270 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NKX1-1Q15270 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NKX1-1Q15270 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
NKX1-1Q15270 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NKX1-1Q15270 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NKX1-1Q15270 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NKX1-1Q15270 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NKX1-1Q15270 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NKX1-1Q15270 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NKX1-1Q15270 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NKX1-1Q15270 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NKX1-1Q15270 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NKX1-1Q15270 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NKX1-1Q15270 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NKX1-1Q15270 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NKX1-1Q15270 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NKX1-1Q15270 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NKX1-1Q15270 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NKX1-1Q15270 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NKX1-1Q15270 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NKX1-1Q15270 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NKX1-1Q15270 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NKX1-1Q15270 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NKX1-1Q15270 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NKX1-1Q15270 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
NKX1-1Q15270 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NKX1-1Q15270 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NKX1-1Q15270 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
NKX1-1Q15270 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NKX1-1Q15270 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NKX1-1Q15270 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NKX1-1Q15270 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NKX1-1Q15270 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
NKX1-1Q15270 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NKX1-1Q15270 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
NKX1-1Q15270 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
NKX1-1Q15270 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
NKX1-1Q15270 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NKX1-1Q15270 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NKX1-1Q15270 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NKX1-1Q15270 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NKX1-1Q15270 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
NKX1-1Q15270 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
NKX1-1Q15270 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NKX1-1Q15270 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
NKX1-1Q15270 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
NKX1-1Q15270 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
NKX1-1Q15270 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NKX1-1Q15270 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
NKX1-1Q15270 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NKX1-1Q15270 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
NKX1-1Q15270 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
NKX1-1Q15270 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
NKX1-1Q15270 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
NKX1-1Q15270 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
NKX1-1Q15270 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
NKX1-1Q15270 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NKX1-1Q15270 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
NKX1-1Q15270 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
NKX1-1Q15270 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
NKX1-1Q15270 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
NKX1-1Q15270 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
NKX1-1Q15270 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NKX1-1Q15270 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NKX1-1Q15270 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
NKX1-1Q15270 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NKX1-1Q15270 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NKX1-1Q15270 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NKX1-1Q15270 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NKX1-1Q15270 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NKX1-1Q15270 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NKX1-1Q15270 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
NKX1-1Q15270 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NKX1-1Q15270 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NKX1-1Q15270 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
NKX1-1Q15270 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
NKX1-1Q15270 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
NKX1-1Q15270 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NKX1-1Q15270 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
NKX1-1Q15270 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
NKX1-1Q15270 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms