Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
R3HDM1Q15032 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
R3HDM1Q15032 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
R3HDM1Q15032 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
R3HDM1Q15032 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
R3HDM1Q15032 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
R3HDM1Q15032 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
R3HDM1Q15032 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
R3HDM1Q15032 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
R3HDM1Q15032 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
R3HDM1Q15032 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
R3HDM1Q15032 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
R3HDM1Q15032 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
R3HDM1Q15032 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
R3HDM1Q15032 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
R3HDM1Q15032 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
R3HDM1Q15032 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
R3HDM1Q15032 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
R3HDM1Q15032 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
R3HDM1Q15032 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
R3HDM1Q15032 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
R3HDM1Q15032 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC30.31■■■□□ 2.44
R3HDM1Q15032 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
R3HDM1Q15032 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
R3HDM1Q15032 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
R3HDM1Q15032 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
R3HDM1Q15032 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
R3HDM1Q15032 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
R3HDM1Q15032 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
R3HDM1Q15032 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
R3HDM1Q15032 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
R3HDM1Q15032 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
R3HDM1Q15032 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
R3HDM1Q15032 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
R3HDM1Q15032 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
R3HDM1Q15032 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
R3HDM1Q15032 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC30.29■■■□□ 2.44
R3HDM1Q15032 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
R3HDM1Q15032 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
R3HDM1Q15032 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
R3HDM1Q15032 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
R3HDM1Q15032 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
R3HDM1Q15032 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
R3HDM1Q15032 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
R3HDM1Q15032 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC30.28■■■□□ 2.44
R3HDM1Q15032 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
R3HDM1Q15032 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
R3HDM1Q15032 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
R3HDM1Q15032 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
R3HDM1Q15032 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
R3HDM1Q15032 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
R3HDM1Q15032 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
R3HDM1Q15032 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
R3HDM1Q15032 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
R3HDM1Q15032 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
R3HDM1Q15032 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
R3HDM1Q15032 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
R3HDM1Q15032 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
R3HDM1Q15032 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
R3HDM1Q15032 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
R3HDM1Q15032 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
R3HDM1Q15032 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC30.24■■■□□ 2.43
R3HDM1Q15032 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
R3HDM1Q15032 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
R3HDM1Q15032 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
R3HDM1Q15032 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
R3HDM1Q15032 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
R3HDM1Q15032 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
R3HDM1Q15032 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
R3HDM1Q15032 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
R3HDM1Q15032 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
R3HDM1Q15032 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
R3HDM1Q15032 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
R3HDM1Q15032 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
R3HDM1Q15032 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
R3HDM1Q15032 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
R3HDM1Q15032 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
R3HDM1Q15032 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
R3HDM1Q15032 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
R3HDM1Q15032 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
R3HDM1Q15032 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
R3HDM1Q15032 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
R3HDM1Q15032 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
R3HDM1Q15032 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
R3HDM1Q15032 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.43
R3HDM1Q15032 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
R3HDM1Q15032 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
R3HDM1Q15032 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
R3HDM1Q15032 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
R3HDM1Q15032 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
R3HDM1Q15032 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
R3HDM1Q15032 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
R3HDM1Q15032 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
R3HDM1Q15032 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
R3HDM1Q15032 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
R3HDM1Q15032 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
R3HDM1Q15032 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
R3HDM1Q15032 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
R3HDM1Q15032 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
R3HDM1Q15032 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
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