Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNX2Q13950 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNX2Q13950 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNX2Q13950 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNX2Q13950 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNX2Q13950 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNX2Q13950 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNX2Q13950 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNX2Q13950 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNX2Q13950 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNX2Q13950 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNX2Q13950 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNX2Q13950 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNX2Q13950 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNX2Q13950 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNX2Q13950 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNX2Q13950 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNX2Q13950 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNX2Q13950 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNX2Q13950 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNX2Q13950 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNX2Q13950 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNX2Q13950 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNX2Q13950 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNX2Q13950 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNX2Q13950 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNX2Q13950 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNX2Q13950 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNX2Q13950 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNX2Q13950 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNX2Q13950 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNX2Q13950 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNX2Q13950 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNX2Q13950 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNX2Q13950 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNX2Q13950 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUNX2Q13950 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUNX2Q13950 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RUNX2Q13950 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUNX2Q13950 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUNX2Q13950 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUNX2Q13950 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUNX2Q13950 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUNX2Q13950 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUNX2Q13950 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNX2Q13950 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNX2Q13950 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNX2Q13950 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNX2Q13950 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNX2Q13950 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNX2Q13950 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNX2Q13950 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNX2Q13950 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUNX2Q13950 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNX2Q13950 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNX2Q13950 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNX2Q13950 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNX2Q13950 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNX2Q13950 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUNX2Q13950 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNX2Q13950 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNX2Q13950 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNX2Q13950 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNX2Q13950 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNX2Q13950 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNX2Q13950 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUNX2Q13950 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNX2Q13950 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNX2Q13950 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUNX2Q13950 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNX2Q13950 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNX2Q13950 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNX2Q13950 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNX2Q13950 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNX2Q13950 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RUNX2Q13950 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RUNX2Q13950 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RUNX2Q13950 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RUNX2Q13950 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUNX2Q13950 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUNX2Q13950 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUNX2Q13950 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUNX2Q13950 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUNX2Q13950 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUNX2Q13950 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNX2Q13950 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNX2Q13950 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNX2Q13950 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNX2Q13950 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNX2Q13950 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNX2Q13950 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNX2Q13950 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNX2Q13950 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNX2Q13950 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNX2Q13950 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNX2Q13950 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNX2Q13950 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNX2Q13950 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNX2Q13950 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNX2Q13950 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
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