Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUNX3Q13761 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUNX3Q13761 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUNX3Q13761 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUNX3Q13761 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUNX3Q13761 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUNX3Q13761 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUNX3Q13761 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUNX3Q13761 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUNX3Q13761 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUNX3Q13761 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUNX3Q13761 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUNX3Q13761 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUNX3Q13761 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RUNX3Q13761 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUNX3Q13761 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUNX3Q13761 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUNX3Q13761 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
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